Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sbno2Q7TNB8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sbno2Q7TNB8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sbno2Q7TNB8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sbno2Q7TNB8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sbno2Q7TNB8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sbno2Q7TNB8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sbno2Q7TNB8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sbno2Q7TNB8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sbno2Q7TNB8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sbno2Q7TNB8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sbno2Q7TNB8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sbno2Q7TNB8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sbno2Q7TNB8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sbno2Q7TNB8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sbno2Q7TNB8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sbno2Q7TNB8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sbno2Q7TNB8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sbno2Q7TNB8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sbno2Q7TNB8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sbno2Q7TNB8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sbno2Q7TNB8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sbno2Q7TNB8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sbno2Q7TNB8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sbno2Q7TNB8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sbno2Q7TNB8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sbno2Q7TNB8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sbno2Q7TNB8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sbno2Q7TNB8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sbno2Q7TNB8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sbno2Q7TNB8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sbno2Q7TNB8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sbno2Q7TNB8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Sbno2Q7TNB8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sbno2Q7TNB8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sbno2Q7TNB8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sbno2Q7TNB8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sbno2Q7TNB8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sbno2Q7TNB8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sbno2Q7TNB8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sbno2Q7TNB8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sbno2Q7TNB8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sbno2Q7TNB8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sbno2Q7TNB8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sbno2Q7TNB8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sbno2Q7TNB8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sbno2Q7TNB8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sbno2Q7TNB8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sbno2Q7TNB8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sbno2Q7TNB8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sbno2Q7TNB8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sbno2Q7TNB8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sbno2Q7TNB8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sbno2Q7TNB8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Sbno2Q7TNB8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sbno2Q7TNB8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Sbno2Q7TNB8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Sbno2Q7TNB8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sbno2Q7TNB8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sbno2Q7TNB8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Sbno2Q7TNB8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sbno2Q7TNB8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sbno2Q7TNB8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sbno2Q7TNB8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sbno2Q7TNB8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Sbno2Q7TNB8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sbno2Q7TNB8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sbno2Q7TNB8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sbno2Q7TNB8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sbno2Q7TNB8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sbno2Q7TNB8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Sbno2Q7TNB8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sbno2Q7TNB8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Sbno2Q7TNB8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sbno2Q7TNB8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Sbno2Q7TNB8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sbno2Q7TNB8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sbno2Q7TNB8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Sbno2Q7TNB8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sbno2Q7TNB8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sbno2Q7TNB8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sbno2Q7TNB8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sbno2Q7TNB8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sbno2Q7TNB8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sbno2Q7TNB8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sbno2Q7TNB8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sbno2Q7TNB8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sbno2Q7TNB8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sbno2Q7TNB8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sbno2Q7TNB8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Sbno2Q7TNB8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sbno2Q7TNB8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Sbno2Q7TNB8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sbno2Q7TNB8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sbno2Q7TNB8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sbno2Q7TNB8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sbno2Q7TNB8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sbno2Q7TNB8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sbno2Q7TNB8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sbno2Q7TNB8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms