Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmed3Q78IS1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmed3Q78IS1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmed3Q78IS1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmed3Q78IS1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmed3Q78IS1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmed3Q78IS1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmed3Q78IS1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmed3Q78IS1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmed3Q78IS1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmed3Q78IS1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmed3Q78IS1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed3Q78IS1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed3Q78IS1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed3Q78IS1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed3Q78IS1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed3Q78IS1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed3Q78IS1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed3Q78IS1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed3Q78IS1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed3Q78IS1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed3Q78IS1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed3Q78IS1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed3Q78IS1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed3Q78IS1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed3Q78IS1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed3Q78IS1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed3Q78IS1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed3Q78IS1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed3Q78IS1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed3Q78IS1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed3Q78IS1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed3Q78IS1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed3Q78IS1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed3Q78IS1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tmed3Q78IS1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmed3Q78IS1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmed3Q78IS1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmed3Q78IS1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms