Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ncapd3Q6ZQK0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Ncapd3Q6ZQK0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ncapd3Q6ZQK0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ncapd3Q6ZQK0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ncapd3Q6ZQK0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ncapd3Q6ZQK0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ncapd3Q6ZQK0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ncapd3Q6ZQK0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ncapd3Q6ZQK0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ncapd3Q6ZQK0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ncapd3Q6ZQK0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ncapd3Q6ZQK0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ncapd3Q6ZQK0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ncapd3Q6ZQK0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ncapd3Q6ZQK0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
Ncapd3Q6ZQK0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ncapd3Q6ZQK0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ncapd3Q6ZQK0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ncapd3Q6ZQK0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ncapd3Q6ZQK0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ncapd3Q6ZQK0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ncapd3Q6ZQK0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ncapd3Q6ZQK0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ncapd3Q6ZQK0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ncapd3Q6ZQK0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ncapd3Q6ZQK0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ncapd3Q6ZQK0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ncapd3Q6ZQK0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ncapd3Q6ZQK0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ncapd3Q6ZQK0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ncapd3Q6ZQK0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ncapd3Q6ZQK0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ncapd3Q6ZQK0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ncapd3Q6ZQK0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ncapd3Q6ZQK0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ncapd3Q6ZQK0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ncapd3Q6ZQK0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ncapd3Q6ZQK0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ncapd3Q6ZQK0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ncapd3Q6ZQK0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Ncapd3Q6ZQK0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Ncapd3Q6ZQK0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Ncapd3Q6ZQK0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Ncapd3Q6ZQK0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ncapd3Q6ZQK0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ncapd3Q6ZQK0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ncapd3Q6ZQK0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ncapd3Q6ZQK0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ncapd3Q6ZQK0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ncapd3Q6ZQK0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ncapd3Q6ZQK0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ncapd3Q6ZQK0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ncapd3Q6ZQK0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ncapd3Q6ZQK0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ncapd3Q6ZQK0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ncapd3Q6ZQK0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ncapd3Q6ZQK0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ncapd3Q6ZQK0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ncapd3Q6ZQK0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Ncapd3Q6ZQK0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Ncapd3Q6ZQK0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Ncapd3Q6ZQK0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Ncapd3Q6ZQK0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Ncapd3Q6ZQK0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ncapd3Q6ZQK0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ncapd3Q6ZQK0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ncapd3Q6ZQK0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ncapd3Q6ZQK0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ncapd3Q6ZQK0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ncapd3Q6ZQK0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ncapd3Q6ZQK0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ncapd3Q6ZQK0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ncapd3Q6ZQK0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ncapd3Q6ZQK0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ncapd3Q6ZQK0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ncapd3Q6ZQK0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ncapd3Q6ZQK0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Ncapd3Q6ZQK0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Ncapd3Q6ZQK0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms