Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptx4Q6RUU0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ptx4Q6RUU0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptx4Q6RUU0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptx4Q6RUU0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptx4Q6RUU0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptx4Q6RUU0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptx4Q6RUU0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptx4Q6RUU0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptx4Q6RUU0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptx4Q6RUU0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptx4Q6RUU0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptx4Q6RUU0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptx4Q6RUU0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptx4Q6RUU0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptx4Q6RUU0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptx4Q6RUU0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptx4Q6RUU0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptx4Q6RUU0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptx4Q6RUU0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptx4Q6RUU0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptx4Q6RUU0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptx4Q6RUU0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptx4Q6RUU0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptx4Q6RUU0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptx4Q6RUU0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptx4Q6RUU0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptx4Q6RUU0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptx4Q6RUU0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptx4Q6RUU0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptx4Q6RUU0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptx4Q6RUU0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptx4Q6RUU0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptx4Q6RUU0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptx4Q6RUU0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptx4Q6RUU0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptx4Q6RUU0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptx4Q6RUU0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptx4Q6RUU0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptx4Q6RUU0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptx4Q6RUU0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptx4Q6RUU0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptx4Q6RUU0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptx4Q6RUU0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptx4Q6RUU0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptx4Q6RUU0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptx4Q6RUU0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptx4Q6RUU0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptx4Q6RUU0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptx4Q6RUU0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptx4Q6RUU0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptx4Q6RUU0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptx4Q6RUU0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptx4Q6RUU0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptx4Q6RUU0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptx4Q6RUU0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptx4Q6RUU0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptx4Q6RUU0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptx4Q6RUU0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptx4Q6RUU0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptx4Q6RUU0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptx4Q6RUU0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptx4Q6RUU0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptx4Q6RUU0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptx4Q6RUU0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptx4Q6RUU0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ptx4Q6RUU0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptx4Q6RUU0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptx4Q6RUU0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptx4Q6RUU0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptx4Q6RUU0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptx4Q6RUU0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptx4Q6RUU0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptx4Q6RUU0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptx4Q6RUU0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptx4Q6RUU0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptx4Q6RUU0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptx4Q6RUU0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptx4Q6RUU0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptx4Q6RUU0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptx4Q6RUU0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptx4Q6RUU0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptx4Q6RUU0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptx4Q6RUU0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptx4Q6RUU0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptx4Q6RUU0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptx4Q6RUU0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptx4Q6RUU0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptx4Q6RUU0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptx4Q6RUU0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptx4Q6RUU0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptx4Q6RUU0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptx4Q6RUU0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptx4Q6RUU0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptx4Q6RUU0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptx4Q6RUU0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptx4Q6RUU0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptx4Q6RUU0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptx4Q6RUU0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptx4Q6RUU0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms