Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms