Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Neil2Q6R2P8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Neil2Q6R2P8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Neil2Q6R2P8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms