Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFY1

Fchsd1, F-BAR and double SH3 domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd1Q6PFY1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Fchsd1Q6PFY1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fchsd1Q6PFY1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Fchsd1Q6PFY1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fchsd1Q6PFY1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fchsd1Q6PFY1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fchsd1Q6PFY1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fchsd1Q6PFY1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fchsd1Q6PFY1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fchsd1Q6PFY1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fchsd1Q6PFY1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fchsd1Q6PFY1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fchsd1Q6PFY1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Fchsd1Q6PFY1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fchsd1Q6PFY1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fchsd1Q6PFY1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fchsd1Q6PFY1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fchsd1Q6PFY1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Fchsd1Q6PFY1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fchsd1Q6PFY1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fchsd1Q6PFY1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fchsd1Q6PFY1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fchsd1Q6PFY1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fchsd1Q6PFY1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fchsd1Q6PFY1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fchsd1Q6PFY1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fchsd1Q6PFY1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Fchsd1Q6PFY1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fchsd1Q6PFY1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fchsd1Q6PFY1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fchsd1Q6PFY1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fchsd1Q6PFY1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fchsd1Q6PFY1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fchsd1Q6PFY1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fchsd1Q6PFY1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fchsd1Q6PFY1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fchsd1Q6PFY1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fchsd1Q6PFY1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fchsd1Q6PFY1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fchsd1Q6PFY1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fchsd1Q6PFY1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fchsd1Q6PFY1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fchsd1Q6PFY1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fchsd1Q6PFY1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Fchsd1Q6PFY1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Fchsd1Q6PFY1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fchsd1Q6PFY1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fchsd1Q6PFY1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fchsd1Q6PFY1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fchsd1Q6PFY1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fchsd1Q6PFY1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fchsd1Q6PFY1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fchsd1Q6PFY1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fchsd1Q6PFY1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fchsd1Q6PFY1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fchsd1Q6PFY1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fchsd1Q6PFY1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fchsd1Q6PFY1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fchsd1Q6PFY1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fchsd1Q6PFY1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fchsd1Q6PFY1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fchsd1Q6PFY1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fchsd1Q6PFY1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fchsd1Q6PFY1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fchsd1Q6PFY1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fchsd1Q6PFY1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fchsd1Q6PFY1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fchsd1Q6PFY1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fchsd1Q6PFY1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fchsd1Q6PFY1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fchsd1Q6PFY1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fchsd1Q6PFY1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fchsd1Q6PFY1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fchsd1Q6PFY1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fchsd1Q6PFY1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fchsd1Q6PFY1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fchsd1Q6PFY1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Fchsd1Q6PFY1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fchsd1Q6PFY1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fchsd1Q6PFY1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fchsd1Q6PFY1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fchsd1Q6PFY1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fchsd1Q6PFY1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fchsd1Q6PFY1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fchsd1Q6PFY1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fchsd1Q6PFY1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fchsd1Q6PFY1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fchsd1Q6PFY1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fchsd1Q6PFY1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fchsd1Q6PFY1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fchsd1Q6PFY1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fchsd1Q6PFY1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fchsd1Q6PFY1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Fchsd1Q6PFY1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fchsd1Q6PFY1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fchsd1Q6PFY1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fchsd1Q6PFY1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fchsd1Q6PFY1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fchsd1Q6PFY1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fchsd1Q6PFY1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms