Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFQ7

Rasa4, Ras GTPase-activating protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa4Q6PFQ7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rasa4Q6PFQ7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rasa4Q6PFQ7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rasa4Q6PFQ7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rasa4Q6PFQ7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rasa4Q6PFQ7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rasa4Q6PFQ7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rasa4Q6PFQ7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rasa4Q6PFQ7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rasa4Q6PFQ7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rasa4Q6PFQ7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rasa4Q6PFQ7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rasa4Q6PFQ7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rasa4Q6PFQ7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rasa4Q6PFQ7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rasa4Q6PFQ7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rasa4Q6PFQ7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rasa4Q6PFQ7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rasa4Q6PFQ7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rasa4Q6PFQ7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rasa4Q6PFQ7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rasa4Q6PFQ7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rasa4Q6PFQ7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rasa4Q6PFQ7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rasa4Q6PFQ7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rasa4Q6PFQ7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rasa4Q6PFQ7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rasa4Q6PFQ7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rasa4Q6PFQ7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rasa4Q6PFQ7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rasa4Q6PFQ7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rasa4Q6PFQ7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rasa4Q6PFQ7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rasa4Q6PFQ7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rasa4Q6PFQ7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rasa4Q6PFQ7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rasa4Q6PFQ7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rasa4Q6PFQ7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rasa4Q6PFQ7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rasa4Q6PFQ7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rasa4Q6PFQ7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rasa4Q6PFQ7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rasa4Q6PFQ7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rasa4Q6PFQ7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rasa4Q6PFQ7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rasa4Q6PFQ7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rasa4Q6PFQ7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rasa4Q6PFQ7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rasa4Q6PFQ7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rasa4Q6PFQ7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rasa4Q6PFQ7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rasa4Q6PFQ7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rasa4Q6PFQ7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rasa4Q6PFQ7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rasa4Q6PFQ7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rasa4Q6PFQ7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rasa4Q6PFQ7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rasa4Q6PFQ7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rasa4Q6PFQ7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rasa4Q6PFQ7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rasa4Q6PFQ7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rasa4Q6PFQ7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rasa4Q6PFQ7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rasa4Q6PFQ7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rasa4Q6PFQ7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rasa4Q6PFQ7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rasa4Q6PFQ7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rasa4Q6PFQ7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rasa4Q6PFQ7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rasa4Q6PFQ7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rasa4Q6PFQ7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rasa4Q6PFQ7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rasa4Q6PFQ7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rasa4Q6PFQ7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rasa4Q6PFQ7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rasa4Q6PFQ7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rasa4Q6PFQ7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rasa4Q6PFQ7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rasa4Q6PFQ7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rasa4Q6PFQ7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rasa4Q6PFQ7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rasa4Q6PFQ7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rasa4Q6PFQ7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rasa4Q6PFQ7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rasa4Q6PFQ7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rasa4Q6PFQ7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rasa4Q6PFQ7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rasa4Q6PFQ7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rasa4Q6PFQ7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rasa4Q6PFQ7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rasa4Q6PFQ7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rasa4Q6PFQ7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rasa4Q6PFQ7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rasa4Q6PFQ7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rasa4Q6PFQ7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rasa4Q6PFQ7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rasa4Q6PFQ7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rasa4Q6PFQ7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rasa4Q6PFQ7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rasa4Q6PFQ7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms