Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ecm29Q6PDI5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ecm29Q6PDI5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ecm29Q6PDI5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ecm29Q6PDI5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ecm29Q6PDI5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ecm29Q6PDI5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ecm29Q6PDI5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ecm29Q6PDI5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ecm29Q6PDI5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ecm29Q6PDI5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ecm29Q6PDI5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ecm29Q6PDI5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ecm29Q6PDI5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ecm29Q6PDI5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ecm29Q6PDI5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ecm29Q6PDI5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ecm29Q6PDI5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ecm29Q6PDI5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ecm29Q6PDI5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ecm29Q6PDI5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ecm29Q6PDI5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ecm29Q6PDI5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ecm29Q6PDI5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ecm29Q6PDI5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ecm29Q6PDI5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ecm29Q6PDI5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ecm29Q6PDI5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ecm29Q6PDI5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ecm29Q6PDI5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ecm29Q6PDI5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ecm29Q6PDI5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ecm29Q6PDI5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Ecm29Q6PDI5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ecm29Q6PDI5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ecm29Q6PDI5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ecm29Q6PDI5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ecm29Q6PDI5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ecm29Q6PDI5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ecm29Q6PDI5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ecm29Q6PDI5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ecm29Q6PDI5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ecm29Q6PDI5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ecm29Q6PDI5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ecm29Q6PDI5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ecm29Q6PDI5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ecm29Q6PDI5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ecm29Q6PDI5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ecm29Q6PDI5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ecm29Q6PDI5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ecm29Q6PDI5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ecm29Q6PDI5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ecm29Q6PDI5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ecm29Q6PDI5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ecm29Q6PDI5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ecm29Q6PDI5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ecm29Q6PDI5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ecm29Q6PDI5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ecm29Q6PDI5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ecm29Q6PDI5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ecm29Q6PDI5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ecm29Q6PDI5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ecm29Q6PDI5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ecm29Q6PDI5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ecm29Q6PDI5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ecm29Q6PDI5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ecm29Q6PDI5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ecm29Q6PDI5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ecm29Q6PDI5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ecm29Q6PDI5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ecm29Q6PDI5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ecm29Q6PDI5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ecm29Q6PDI5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ecm29Q6PDI5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ecm29Q6PDI5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ecm29Q6PDI5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ecm29Q6PDI5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ecm29Q6PDI5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ecm29Q6PDI5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ecm29Q6PDI5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ecm29Q6PDI5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ecm29Q6PDI5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ecm29Q6PDI5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ecm29Q6PDI5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ecm29Q6PDI5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ecm29Q6PDI5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ecm29Q6PDI5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ecm29Q6PDI5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ecm29Q6PDI5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ecm29Q6PDI5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ecm29Q6PDI5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ecm29Q6PDI5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ecm29Q6PDI5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ecm29Q6PDI5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ecm29Q6PDI5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ecm29Q6PDI5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ecm29Q6PDI5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ecm29Q6PDI5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ecm29Q6PDI5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ecm29Q6PDI5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms