Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SvoplQ6PDF3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SvoplQ6PDF3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SvoplQ6PDF3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SvoplQ6PDF3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SvoplQ6PDF3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SvoplQ6PDF3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SvoplQ6PDF3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SvoplQ6PDF3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SvoplQ6PDF3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SvoplQ6PDF3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SvoplQ6PDF3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SvoplQ6PDF3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SvoplQ6PDF3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SvoplQ6PDF3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SvoplQ6PDF3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SvoplQ6PDF3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SvoplQ6PDF3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SvoplQ6PDF3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SvoplQ6PDF3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SvoplQ6PDF3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SvoplQ6PDF3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SvoplQ6PDF3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SvoplQ6PDF3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SvoplQ6PDF3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SvoplQ6PDF3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SvoplQ6PDF3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SvoplQ6PDF3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SvoplQ6PDF3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SvoplQ6PDF3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SvoplQ6PDF3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SvoplQ6PDF3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SvoplQ6PDF3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SvoplQ6PDF3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SvoplQ6PDF3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SvoplQ6PDF3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SvoplQ6PDF3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SvoplQ6PDF3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SvoplQ6PDF3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SvoplQ6PDF3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SvoplQ6PDF3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SvoplQ6PDF3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SvoplQ6PDF3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SvoplQ6PDF3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SvoplQ6PDF3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SvoplQ6PDF3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SvoplQ6PDF3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SvoplQ6PDF3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SvoplQ6PDF3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SvoplQ6PDF3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SvoplQ6PDF3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SvoplQ6PDF3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SvoplQ6PDF3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SvoplQ6PDF3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SvoplQ6PDF3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SvoplQ6PDF3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SvoplQ6PDF3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SvoplQ6PDF3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SvoplQ6PDF3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SvoplQ6PDF3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SvoplQ6PDF3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SvoplQ6PDF3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SvoplQ6PDF3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SvoplQ6PDF3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SvoplQ6PDF3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SvoplQ6PDF3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SvoplQ6PDF3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SvoplQ6PDF3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SvoplQ6PDF3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SvoplQ6PDF3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SvoplQ6PDF3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SvoplQ6PDF3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SvoplQ6PDF3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SvoplQ6PDF3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SvoplQ6PDF3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SvoplQ6PDF3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SvoplQ6PDF3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SvoplQ6PDF3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SvoplQ6PDF3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SvoplQ6PDF3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SvoplQ6PDF3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SvoplQ6PDF3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SvoplQ6PDF3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SvoplQ6PDF3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SvoplQ6PDF3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SvoplQ6PDF3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SvoplQ6PDF3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SvoplQ6PDF3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SvoplQ6PDF3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SvoplQ6PDF3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SvoplQ6PDF3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SvoplQ6PDF3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SvoplQ6PDF3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SvoplQ6PDF3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SvoplQ6PDF3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SvoplQ6PDF3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SvoplQ6PDF3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SvoplQ6PDF3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SvoplQ6PDF3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SvoplQ6PDF3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms