Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E1

Zmiz1, Zinc finger MIZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmiz1Q6P1E1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zmiz1Q6P1E1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zmiz1Q6P1E1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zmiz1Q6P1E1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zmiz1Q6P1E1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zmiz1Q6P1E1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zmiz1Q6P1E1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zmiz1Q6P1E1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zmiz1Q6P1E1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zmiz1Q6P1E1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zmiz1Q6P1E1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Zmiz1Q6P1E1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Zmiz1Q6P1E1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Zmiz1Q6P1E1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zmiz1Q6P1E1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zmiz1Q6P1E1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zmiz1Q6P1E1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zmiz1Q6P1E1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zmiz1Q6P1E1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zmiz1Q6P1E1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zmiz1Q6P1E1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Zmiz1Q6P1E1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zmiz1Q6P1E1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zmiz1Q6P1E1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zmiz1Q6P1E1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zmiz1Q6P1E1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zmiz1Q6P1E1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zmiz1Q6P1E1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zmiz1Q6P1E1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zmiz1Q6P1E1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Zmiz1Q6P1E1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Zmiz1Q6P1E1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zmiz1Q6P1E1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zmiz1Q6P1E1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zmiz1Q6P1E1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zmiz1Q6P1E1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zmiz1Q6P1E1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zmiz1Q6P1E1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zmiz1Q6P1E1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zmiz1Q6P1E1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zmiz1Q6P1E1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zmiz1Q6P1E1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zmiz1Q6P1E1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zmiz1Q6P1E1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zmiz1Q6P1E1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zmiz1Q6P1E1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zmiz1Q6P1E1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zmiz1Q6P1E1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zmiz1Q6P1E1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zmiz1Q6P1E1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zmiz1Q6P1E1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zmiz1Q6P1E1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zmiz1Q6P1E1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zmiz1Q6P1E1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zmiz1Q6P1E1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zmiz1Q6P1E1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zmiz1Q6P1E1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zmiz1Q6P1E1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zmiz1Q6P1E1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zmiz1Q6P1E1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zmiz1Q6P1E1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zmiz1Q6P1E1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zmiz1Q6P1E1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zmiz1Q6P1E1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zmiz1Q6P1E1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zmiz1Q6P1E1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Zmiz1Q6P1E1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Zmiz1Q6P1E1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zmiz1Q6P1E1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zmiz1Q6P1E1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zmiz1Q6P1E1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zmiz1Q6P1E1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zmiz1Q6P1E1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zmiz1Q6P1E1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Zmiz1Q6P1E1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zmiz1Q6P1E1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zmiz1Q6P1E1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zmiz1Q6P1E1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zmiz1Q6P1E1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zmiz1Q6P1E1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zmiz1Q6P1E1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zmiz1Q6P1E1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zmiz1Q6P1E1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zmiz1Q6P1E1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zmiz1Q6P1E1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zmiz1Q6P1E1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zmiz1Q6P1E1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zmiz1Q6P1E1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zmiz1Q6P1E1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zmiz1Q6P1E1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zmiz1Q6P1E1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zmiz1Q6P1E1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zmiz1Q6P1E1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zmiz1Q6P1E1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zmiz1Q6P1E1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zmiz1Q6P1E1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zmiz1Q6P1E1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zmiz1Q6P1E1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zmiz1Q6P1E1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zmiz1Q6P1E1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms