Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ4

Paxip1, PAX-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,056 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxip1Q6NZQ4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Paxip1Q6NZQ4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Paxip1Q6NZQ4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Paxip1Q6NZQ4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Paxip1Q6NZQ4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Paxip1Q6NZQ4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Paxip1Q6NZQ4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Paxip1Q6NZQ4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Paxip1Q6NZQ4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Paxip1Q6NZQ4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Paxip1Q6NZQ4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Paxip1Q6NZQ4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Paxip1Q6NZQ4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Paxip1Q6NZQ4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Paxip1Q6NZQ4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Paxip1Q6NZQ4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Paxip1Q6NZQ4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Paxip1Q6NZQ4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Paxip1Q6NZQ4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Paxip1Q6NZQ4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 178.6 ms