Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ptpdc1Q6NZK8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ptpdc1Q6NZK8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ptpdc1Q6NZK8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ptpdc1Q6NZK8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ptpdc1Q6NZK8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ptpdc1Q6NZK8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ptpdc1Q6NZK8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ptpdc1Q6NZK8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ptpdc1Q6NZK8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ptpdc1Q6NZK8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ptpdc1Q6NZK8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ptpdc1Q6NZK8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ptpdc1Q6NZK8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ptpdc1Q6NZK8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ptpdc1Q6NZK8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ptpdc1Q6NZK8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ptpdc1Q6NZK8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ptpdc1Q6NZK8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ptpdc1Q6NZK8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ptpdc1Q6NZK8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ptpdc1Q6NZK8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ptpdc1Q6NZK8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ptpdc1Q6NZK8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ptpdc1Q6NZK8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ptpdc1Q6NZK8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ptpdc1Q6NZK8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ptpdc1Q6NZK8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ptpdc1Q6NZK8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ptpdc1Q6NZK8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ptpdc1Q6NZK8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ptpdc1Q6NZK8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ptpdc1Q6NZK8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ptpdc1Q6NZK8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ptpdc1Q6NZK8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ptpdc1Q6NZK8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ptpdc1Q6NZK8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ptpdc1Q6NZK8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ptpdc1Q6NZK8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ptpdc1Q6NZK8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ptpdc1Q6NZK8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ptpdc1Q6NZK8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ptpdc1Q6NZK8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ptpdc1Q6NZK8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ptpdc1Q6NZK8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ptpdc1Q6NZK8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ptpdc1Q6NZK8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ptpdc1Q6NZK8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ptpdc1Q6NZK8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ptpdc1Q6NZK8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ptpdc1Q6NZK8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ptpdc1Q6NZK8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ptpdc1Q6NZK8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ptpdc1Q6NZK8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ptpdc1Q6NZK8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ptpdc1Q6NZK8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ptpdc1Q6NZK8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ptpdc1Q6NZK8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ptpdc1Q6NZK8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ptpdc1Q6NZK8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ptpdc1Q6NZK8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ptpdc1Q6NZK8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ptpdc1Q6NZK8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ptpdc1Q6NZK8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ptpdc1Q6NZK8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ptpdc1Q6NZK8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ptpdc1Q6NZK8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ptpdc1Q6NZK8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ptpdc1Q6NZK8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ptpdc1Q6NZK8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ptpdc1Q6NZK8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ptpdc1Q6NZK8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ptpdc1Q6NZK8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ptpdc1Q6NZK8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Ptpdc1Q6NZK8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ptpdc1Q6NZK8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ptpdc1Q6NZK8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ptpdc1Q6NZK8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ptpdc1Q6NZK8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ptpdc1Q6NZK8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ptpdc1Q6NZK8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ptpdc1Q6NZK8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ptpdc1Q6NZK8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Ptpdc1Q6NZK8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ptpdc1Q6NZK8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ptpdc1Q6NZK8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ptpdc1Q6NZK8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ptpdc1Q6NZK8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ptpdc1Q6NZK8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ptpdc1Q6NZK8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ptpdc1Q6NZK8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ptpdc1Q6NZK8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ptpdc1Q6NZK8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ptpdc1Q6NZK8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ptpdc1Q6NZK8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ptpdc1Q6NZK8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 196.1 ms