Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Asic1Q6NXK8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Asic1Q6NXK8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Asic1Q6NXK8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Asic1Q6NXK8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Asic1Q6NXK8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Asic1Q6NXK8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Asic1Q6NXK8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Asic1Q6NXK8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Asic1Q6NXK8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Asic1Q6NXK8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Asic1Q6NXK8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Asic1Q6NXK8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Asic1Q6NXK8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Asic1Q6NXK8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Asic1Q6NXK8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Asic1Q6NXK8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Asic1Q6NXK8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Asic1Q6NXK8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Asic1Q6NXK8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Asic1Q6NXK8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Asic1Q6NXK8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Asic1Q6NXK8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Asic1Q6NXK8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Asic1Q6NXK8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Asic1Q6NXK8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Asic1Q6NXK8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Asic1Q6NXK8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Asic1Q6NXK8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Asic1Q6NXK8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Asic1Q6NXK8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Asic1Q6NXK8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Asic1Q6NXK8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Asic1Q6NXK8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Asic1Q6NXK8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Asic1Q6NXK8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Asic1Q6NXK8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Asic1Q6NXK8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Asic1Q6NXK8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Asic1Q6NXK8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Asic1Q6NXK8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Asic1Q6NXK8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Asic1Q6NXK8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Asic1Q6NXK8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Asic1Q6NXK8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Asic1Q6NXK8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Asic1Q6NXK8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Asic1Q6NXK8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Asic1Q6NXK8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Asic1Q6NXK8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Asic1Q6NXK8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Asic1Q6NXK8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Asic1Q6NXK8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Asic1Q6NXK8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Asic1Q6NXK8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Asic1Q6NXK8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Asic1Q6NXK8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Asic1Q6NXK8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Asic1Q6NXK8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Asic1Q6NXK8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Asic1Q6NXK8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Asic1Q6NXK8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Asic1Q6NXK8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Asic1Q6NXK8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Asic1Q6NXK8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Asic1Q6NXK8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Asic1Q6NXK8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Asic1Q6NXK8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Asic1Q6NXK8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Asic1Q6NXK8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Asic1Q6NXK8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Asic1Q6NXK8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Asic1Q6NXK8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Asic1Q6NXK8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Asic1Q6NXK8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Asic1Q6NXK8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Asic1Q6NXK8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Asic1Q6NXK8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Asic1Q6NXK8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Asic1Q6NXK8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Asic1Q6NXK8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Asic1Q6NXK8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Asic1Q6NXK8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Asic1Q6NXK8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Asic1Q6NXK8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Asic1Q6NXK8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Asic1Q6NXK8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Asic1Q6NXK8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Asic1Q6NXK8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Asic1Q6NXK8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Asic1Q6NXK8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Asic1Q6NXK8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Asic1Q6NXK8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Asic1Q6NXK8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Asic1Q6NXK8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Asic1Q6NXK8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Asic1Q6NXK8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Asic1Q6NXK8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Asic1Q6NXK8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Asic1Q6NXK8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms