Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gpbp1Q6NXH3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gpbp1Q6NXH3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gpbp1Q6NXH3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gpbp1Q6NXH3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gpbp1Q6NXH3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Gpbp1Q6NXH3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gpbp1Q6NXH3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gpbp1Q6NXH3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gpbp1Q6NXH3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gpbp1Q6NXH3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gpbp1Q6NXH3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gpbp1Q6NXH3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gpbp1Q6NXH3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gpbp1Q6NXH3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gpbp1Q6NXH3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gpbp1Q6NXH3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gpbp1Q6NXH3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gpbp1Q6NXH3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gpbp1Q6NXH3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gpbp1Q6NXH3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gpbp1Q6NXH3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gpbp1Q6NXH3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gpbp1Q6NXH3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gpbp1Q6NXH3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gpbp1Q6NXH3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gpbp1Q6NXH3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gpbp1Q6NXH3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gpbp1Q6NXH3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gpbp1Q6NXH3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gpbp1Q6NXH3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gpbp1Q6NXH3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Gpbp1Q6NXH3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gpbp1Q6NXH3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gpbp1Q6NXH3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gpbp1Q6NXH3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gpbp1Q6NXH3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gpbp1Q6NXH3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gpbp1Q6NXH3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gpbp1Q6NXH3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Gpbp1Q6NXH3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gpbp1Q6NXH3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gpbp1Q6NXH3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gpbp1Q6NXH3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gpbp1Q6NXH3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gpbp1Q6NXH3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gpbp1Q6NXH3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gpbp1Q6NXH3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gpbp1Q6NXH3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gpbp1Q6NXH3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gpbp1Q6NXH3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gpbp1Q6NXH3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gpbp1Q6NXH3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gpbp1Q6NXH3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gpbp1Q6NXH3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gpbp1Q6NXH3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Gpbp1Q6NXH3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gpbp1Q6NXH3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gpbp1Q6NXH3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gpbp1Q6NXH3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gpbp1Q6NXH3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gpbp1Q6NXH3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Gpbp1Q6NXH3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gpbp1Q6NXH3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gpbp1Q6NXH3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gpbp1Q6NXH3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gpbp1Q6NXH3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gpbp1Q6NXH3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Gpbp1Q6NXH3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gpbp1Q6NXH3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gpbp1Q6NXH3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gpbp1Q6NXH3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gpbp1Q6NXH3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Gpbp1Q6NXH3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gpbp1Q6NXH3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Gpbp1Q6NXH3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gpbp1Q6NXH3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gpbp1Q6NXH3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gpbp1Q6NXH3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gpbp1Q6NXH3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gpbp1Q6NXH3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gpbp1Q6NXH3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gpbp1Q6NXH3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gpbp1Q6NXH3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gpbp1Q6NXH3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gpbp1Q6NXH3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gpbp1Q6NXH3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gpbp1Q6NXH3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gpbp1Q6NXH3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gpbp1Q6NXH3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gpbp1Q6NXH3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gpbp1Q6NXH3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gpbp1Q6NXH3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gpbp1Q6NXH3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gpbp1Q6NXH3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gpbp1Q6NXH3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gpbp1Q6NXH3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gpbp1Q6NXH3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gpbp1Q6NXH3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gpbp1Q6NXH3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms