Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Wdr44Q6NVE8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Wdr44Q6NVE8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Wdr44Q6NVE8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Wdr44Q6NVE8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Wdr44Q6NVE8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Wdr44Q6NVE8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Wdr44Q6NVE8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Wdr44Q6NVE8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Wdr44Q6NVE8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Wdr44Q6NVE8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Wdr44Q6NVE8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Wdr44Q6NVE8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Wdr44Q6NVE8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Wdr44Q6NVE8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Wdr44Q6NVE8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Wdr44Q6NVE8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Wdr44Q6NVE8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Wdr44Q6NVE8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Wdr44Q6NVE8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Wdr44Q6NVE8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Wdr44Q6NVE8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Wdr44Q6NVE8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Wdr44Q6NVE8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Wdr44Q6NVE8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Wdr44Q6NVE8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Wdr44Q6NVE8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Wdr44Q6NVE8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Wdr44Q6NVE8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Wdr44Q6NVE8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Wdr44Q6NVE8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Wdr44Q6NVE8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Wdr44Q6NVE8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Wdr44Q6NVE8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Wdr44Q6NVE8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Wdr44Q6NVE8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Wdr44Q6NVE8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Wdr44Q6NVE8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Wdr44Q6NVE8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Wdr44Q6NVE8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Wdr44Q6NVE8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Wdr44Q6NVE8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Wdr44Q6NVE8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Wdr44Q6NVE8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Wdr44Q6NVE8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Wdr44Q6NVE8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Wdr44Q6NVE8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Wdr44Q6NVE8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Wdr44Q6NVE8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Wdr44Q6NVE8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Wdr44Q6NVE8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Wdr44Q6NVE8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Wdr44Q6NVE8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Wdr44Q6NVE8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Wdr44Q6NVE8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Wdr44Q6NVE8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Wdr44Q6NVE8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Wdr44Q6NVE8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Wdr44Q6NVE8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Wdr44Q6NVE8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Wdr44Q6NVE8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Wdr44Q6NVE8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Wdr44Q6NVE8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Wdr44Q6NVE8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Wdr44Q6NVE8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Wdr44Q6NVE8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Wdr44Q6NVE8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Wdr44Q6NVE8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Wdr44Q6NVE8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Wdr44Q6NVE8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Wdr44Q6NVE8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Wdr44Q6NVE8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Wdr44Q6NVE8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Wdr44Q6NVE8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Wdr44Q6NVE8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Wdr44Q6NVE8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Wdr44Q6NVE8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Wdr44Q6NVE8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Wdr44Q6NVE8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Wdr44Q6NVE8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Wdr44Q6NVE8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Wdr44Q6NVE8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Wdr44Q6NVE8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Wdr44Q6NVE8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Wdr44Q6NVE8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Wdr44Q6NVE8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Wdr44Q6NVE8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Wdr44Q6NVE8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Wdr44Q6NVE8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Wdr44Q6NVE8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Wdr44Q6NVE8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Wdr44Q6NVE8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Wdr44Q6NVE8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Wdr44Q6NVE8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Wdr44Q6NVE8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Wdr44Q6NVE8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Wdr44Q6NVE8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Wdr44Q6NVE8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Wdr44Q6NVE8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Wdr44Q6NVE8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms