Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
SphkapQ6NSW3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SphkapQ6NSW3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SphkapQ6NSW3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SphkapQ6NSW3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SphkapQ6NSW3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SphkapQ6NSW3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SphkapQ6NSW3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SphkapQ6NSW3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
SphkapQ6NSW3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SphkapQ6NSW3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SphkapQ6NSW3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SphkapQ6NSW3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SphkapQ6NSW3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SphkapQ6NSW3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SphkapQ6NSW3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SphkapQ6NSW3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SphkapQ6NSW3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SphkapQ6NSW3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SphkapQ6NSW3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SphkapQ6NSW3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
SphkapQ6NSW3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SphkapQ6NSW3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SphkapQ6NSW3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SphkapQ6NSW3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SphkapQ6NSW3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SphkapQ6NSW3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SphkapQ6NSW3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SphkapQ6NSW3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SphkapQ6NSW3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SphkapQ6NSW3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SphkapQ6NSW3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SphkapQ6NSW3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SphkapQ6NSW3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SphkapQ6NSW3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SphkapQ6NSW3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
SphkapQ6NSW3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SphkapQ6NSW3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
SphkapQ6NSW3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SphkapQ6NSW3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SphkapQ6NSW3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SphkapQ6NSW3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SphkapQ6NSW3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SphkapQ6NSW3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SphkapQ6NSW3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SphkapQ6NSW3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SphkapQ6NSW3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SphkapQ6NSW3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SphkapQ6NSW3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SphkapQ6NSW3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SphkapQ6NSW3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SphkapQ6NSW3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SphkapQ6NSW3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
SphkapQ6NSW3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SphkapQ6NSW3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SphkapQ6NSW3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SphkapQ6NSW3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SphkapQ6NSW3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SphkapQ6NSW3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SphkapQ6NSW3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SphkapQ6NSW3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SphkapQ6NSW3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SphkapQ6NSW3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
SphkapQ6NSW3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SphkapQ6NSW3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SphkapQ6NSW3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SphkapQ6NSW3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SphkapQ6NSW3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SphkapQ6NSW3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SphkapQ6NSW3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SphkapQ6NSW3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SphkapQ6NSW3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SphkapQ6NSW3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SphkapQ6NSW3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SphkapQ6NSW3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SphkapQ6NSW3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SphkapQ6NSW3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SphkapQ6NSW3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SphkapQ6NSW3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SphkapQ6NSW3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SphkapQ6NSW3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SphkapQ6NSW3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SphkapQ6NSW3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SphkapQ6NSW3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SphkapQ6NSW3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SphkapQ6NSW3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SphkapQ6NSW3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
SphkapQ6NSW3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SphkapQ6NSW3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
SphkapQ6NSW3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SphkapQ6NSW3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SphkapQ6NSW3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SphkapQ6NSW3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SphkapQ6NSW3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SphkapQ6NSW3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SphkapQ6NSW3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SphkapQ6NSW3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SphkapQ6NSW3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SphkapQ6NSW3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SphkapQ6NSW3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms