Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSU2

2810408A11Rik, RIKEN cDNA 2810408A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2810408A11RikQ6NSU2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
2810408A11RikQ6NSU2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
2810408A11RikQ6NSU2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
2810408A11RikQ6NSU2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
2810408A11RikQ6NSU2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
2810408A11RikQ6NSU2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
2810408A11RikQ6NSU2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
2810408A11RikQ6NSU2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
2810408A11RikQ6NSU2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
2810408A11RikQ6NSU2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
2810408A11RikQ6NSU2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
2810408A11RikQ6NSU2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
2810408A11RikQ6NSU2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms