Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Pdcd11Q6NS46 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Pdcd11Q6NS46 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Pdcd11Q6NS46 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Pdcd11Q6NS46 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Pdcd11Q6NS46 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Pdcd11Q6NS46 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Pdcd11Q6NS46 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Pdcd11Q6NS46 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Pdcd11Q6NS46 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Pdcd11Q6NS46 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Pdcd11Q6NS46 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Pdcd11Q6NS46 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Pdcd11Q6NS46 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Pdcd11Q6NS46 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Pdcd11Q6NS46 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Pdcd11Q6NS46 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Pdcd11Q6NS46 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Pdcd11Q6NS46 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Pdcd11Q6NS46 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Pdcd11Q6NS46 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Pdcd11Q6NS46 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Pdcd11Q6NS46 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Pdcd11Q6NS46 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Pdcd11Q6NS46 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Pdcd11Q6NS46 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Pdcd11Q6NS46 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Pdcd11Q6NS46 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Pdcd11Q6NS46 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Pdcd11Q6NS46 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Pdcd11Q6NS46 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Pdcd11Q6NS46 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Pdcd11Q6NS46 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Pdcd11Q6NS46 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Pdcd11Q6NS46 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Pdcd11Q6NS46 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Pdcd11Q6NS46 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Pdcd11Q6NS46 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Pdcd11Q6NS46 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Pdcd11Q6NS46 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Pdcd11Q6NS46 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Pdcd11Q6NS46 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Pdcd11Q6NS46 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Pdcd11Q6NS46 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Pdcd11Q6NS46 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Pdcd11Q6NS46 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Pdcd11Q6NS46 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Pdcd11Q6NS46 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Pdcd11Q6NS46 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Pdcd11Q6NS46 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Pdcd11Q6NS46 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Pdcd11Q6NS46 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Pdcd11Q6NS46 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Pdcd11Q6NS46 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Pdcd11Q6NS46 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Pdcd11Q6NS46 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Pdcd11Q6NS46 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Pdcd11Q6NS46 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Pdcd11Q6NS46 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Pdcd11Q6NS46 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Pdcd11Q6NS46 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Pdcd11Q6NS46 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Pdcd11Q6NS46 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Pdcd11Q6NS46 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Pdcd11Q6NS46 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Pdcd11Q6NS46 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Pdcd11Q6NS46 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Pdcd11Q6NS46 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Pdcd11Q6NS46 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Pdcd11Q6NS46 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Pdcd11Q6NS46 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Pdcd11Q6NS46 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Pdcd11Q6NS46 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Pdcd11Q6NS46 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Pdcd11Q6NS46 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Pdcd11Q6NS46 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Pdcd11Q6NS46 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Pdcd11Q6NS46 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Pdcd11Q6NS46 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Pdcd11Q6NS46 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Pdcd11Q6NS46 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Pdcd11Q6NS46 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Pdcd11Q6NS46 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Pdcd11Q6NS46 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Pdcd11Q6NS46 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Pdcd11Q6NS46 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Pdcd11Q6NS46 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Pdcd11Q6NS46 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Pdcd11Q6NS46 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Pdcd11Q6NS46 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Pdcd11Q6NS46 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Pdcd11Q6NS46 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Pdcd11Q6NS46 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Pdcd11Q6NS46 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Pdcd11Q6NS46 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Pdcd11Q6NS46 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Pdcd11Q6NS46 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Pdcd11Q6NS46 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Pdcd11Q6NS46 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Pdcd11Q6NS46 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms