Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Hecw2Q6I6G8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Hecw2Q6I6G8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Hecw2Q6I6G8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Hecw2Q6I6G8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Hecw2Q6I6G8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Hecw2Q6I6G8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Hecw2Q6I6G8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Hecw2Q6I6G8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Hecw2Q6I6G8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Hecw2Q6I6G8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Hecw2Q6I6G8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Hecw2Q6I6G8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Hecw2Q6I6G8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Hecw2Q6I6G8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Hecw2Q6I6G8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Hecw2Q6I6G8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Hecw2Q6I6G8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Hecw2Q6I6G8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Hecw2Q6I6G8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Hecw2Q6I6G8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Hecw2Q6I6G8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Hecw2Q6I6G8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Hecw2Q6I6G8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Hecw2Q6I6G8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Hecw2Q6I6G8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Hecw2Q6I6G8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Hecw2Q6I6G8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Hecw2Q6I6G8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Hecw2Q6I6G8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Hecw2Q6I6G8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Hecw2Q6I6G8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Hecw2Q6I6G8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Hecw2Q6I6G8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Hecw2Q6I6G8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Hecw2Q6I6G8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Hecw2Q6I6G8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Hecw2Q6I6G8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Hecw2Q6I6G8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Hecw2Q6I6G8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Hecw2Q6I6G8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Hecw2Q6I6G8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Hecw2Q6I6G8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Hecw2Q6I6G8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Hecw2Q6I6G8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Hecw2Q6I6G8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Hecw2Q6I6G8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Hecw2Q6I6G8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Hecw2Q6I6G8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Hecw2Q6I6G8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Hecw2Q6I6G8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Hecw2Q6I6G8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Hecw2Q6I6G8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Hecw2Q6I6G8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Hecw2Q6I6G8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Hecw2Q6I6G8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Hecw2Q6I6G8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Hecw2Q6I6G8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Hecw2Q6I6G8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Hecw2Q6I6G8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Hecw2Q6I6G8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Hecw2Q6I6G8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Hecw2Q6I6G8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Hecw2Q6I6G8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Hecw2Q6I6G8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Hecw2Q6I6G8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Hecw2Q6I6G8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Hecw2Q6I6G8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Hecw2Q6I6G8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Hecw2Q6I6G8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Hecw2Q6I6G8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Hecw2Q6I6G8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Hecw2Q6I6G8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Hecw2Q6I6G8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Hecw2Q6I6G8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Hecw2Q6I6G8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Hecw2Q6I6G8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Hecw2Q6I6G8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Hecw2Q6I6G8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Hecw2Q6I6G8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Hecw2Q6I6G8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Hecw2Q6I6G8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Hecw2Q6I6G8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Hecw2Q6I6G8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Hecw2Q6I6G8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Hecw2Q6I6G8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Hecw2Q6I6G8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Hecw2Q6I6G8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Hecw2Q6I6G8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Hecw2Q6I6G8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Hecw2Q6I6G8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Hecw2Q6I6G8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Hecw2Q6I6G8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Hecw2Q6I6G8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Hecw2Q6I6G8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Hecw2Q6I6G8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Hecw2Q6I6G8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Hecw2Q6I6G8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Hecw2Q6I6G8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Hecw2Q6I6G8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms