Protein–RNA interactions for Protein: Q6A009

Ltn1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, mousemouse

Predictions only

Length 1,767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltn1Q6A009 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ltn1Q6A009 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ltn1Q6A009 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ltn1Q6A009 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ltn1Q6A009 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ltn1Q6A009 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ltn1Q6A009 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ltn1Q6A009 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ltn1Q6A009 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ltn1Q6A009 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ltn1Q6A009 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ltn1Q6A009 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ltn1Q6A009 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ltn1Q6A009 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ltn1Q6A009 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ltn1Q6A009 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ltn1Q6A009 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ltn1Q6A009 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ltn1Q6A009 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ltn1Q6A009 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ltn1Q6A009 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ltn1Q6A009 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ltn1Q6A009 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ltn1Q6A009 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ltn1Q6A009 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ltn1Q6A009 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ltn1Q6A009 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ltn1Q6A009 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ltn1Q6A009 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ltn1Q6A009 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ltn1Q6A009 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ltn1Q6A009 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ltn1Q6A009 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ltn1Q6A009 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ltn1Q6A009 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ltn1Q6A009 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ltn1Q6A009 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ltn1Q6A009 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ltn1Q6A009 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ltn1Q6A009 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ltn1Q6A009 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ltn1Q6A009 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ltn1Q6A009 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ltn1Q6A009 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ltn1Q6A009 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ltn1Q6A009 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ltn1Q6A009 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ltn1Q6A009 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ltn1Q6A009 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ltn1Q6A009 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ltn1Q6A009 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ltn1Q6A009 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ltn1Q6A009 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ltn1Q6A009 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ltn1Q6A009 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ltn1Q6A009 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ltn1Q6A009 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ltn1Q6A009 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Ltn1Q6A009 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ltn1Q6A009 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ltn1Q6A009 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ltn1Q6A009 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ltn1Q6A009 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ltn1Q6A009 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ltn1Q6A009 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ltn1Q6A009 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ltn1Q6A009 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ltn1Q6A009 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ltn1Q6A009 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ltn1Q6A009 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ltn1Q6A009 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ltn1Q6A009 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ltn1Q6A009 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ltn1Q6A009 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ltn1Q6A009 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ltn1Q6A009 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ltn1Q6A009 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ltn1Q6A009 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ltn1Q6A009 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ltn1Q6A009 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ltn1Q6A009 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ltn1Q6A009 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ltn1Q6A009 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ltn1Q6A009 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ltn1Q6A009 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ltn1Q6A009 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ltn1Q6A009 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ltn1Q6A009 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ltn1Q6A009 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ltn1Q6A009 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ltn1Q6A009 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ltn1Q6A009 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ltn1Q6A009 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ltn1Q6A009 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ltn1Q6A009 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ltn1Q6A009 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ltn1Q6A009 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ltn1Q6A009 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ltn1Q6A009 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ltn1Q6A009 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.6 ms