Protein–RNA interactions for Protein: Q64322

Npdc1, Neural proliferation differentiation and control protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npdc1Q64322 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Npdc1Q64322 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Npdc1Q64322 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Npdc1Q64322 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Npdc1Q64322 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Npdc1Q64322 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Npdc1Q64322 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Npdc1Q64322 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Npdc1Q64322 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Npdc1Q64322 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Npdc1Q64322 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Npdc1Q64322 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Npdc1Q64322 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Npdc1Q64322 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Npdc1Q64322 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Npdc1Q64322 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Npdc1Q64322 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Npdc1Q64322 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Npdc1Q64322 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Npdc1Q64322 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Npdc1Q64322 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Npdc1Q64322 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Npdc1Q64322 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Npdc1Q64322 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Npdc1Q64322 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Npdc1Q64322 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Npdc1Q64322 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Npdc1Q64322 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Npdc1Q64322 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Npdc1Q64322 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Npdc1Q64322 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Npdc1Q64322 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Npdc1Q64322 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Npdc1Q64322 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Npdc1Q64322 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Npdc1Q64322 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Npdc1Q64322 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Npdc1Q64322 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Npdc1Q64322 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npdc1Q64322 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npdc1Q64322 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npdc1Q64322 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npdc1Q64322 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npdc1Q64322 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npdc1Q64322 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Npdc1Q64322 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Npdc1Q64322 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Npdc1Q64322 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Npdc1Q64322 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Npdc1Q64322 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Npdc1Q64322 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Npdc1Q64322 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Npdc1Q64322 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Npdc1Q64322 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Npdc1Q64322 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Npdc1Q64322 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Npdc1Q64322 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Npdc1Q64322 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Npdc1Q64322 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Npdc1Q64322 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Npdc1Q64322 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npdc1Q64322 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npdc1Q64322 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npdc1Q64322 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npdc1Q64322 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npdc1Q64322 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npdc1Q64322 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npdc1Q64322 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Npdc1Q64322 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npdc1Q64322 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npdc1Q64322 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npdc1Q64322 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npdc1Q64322 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npdc1Q64322 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npdc1Q64322 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npdc1Q64322 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npdc1Q64322 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npdc1Q64322 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npdc1Q64322 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npdc1Q64322 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npdc1Q64322 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npdc1Q64322 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npdc1Q64322 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npdc1Q64322 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npdc1Q64322 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npdc1Q64322 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npdc1Q64322 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npdc1Q64322 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npdc1Q64322 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npdc1Q64322 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npdc1Q64322 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Npdc1Q64322 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Npdc1Q64322 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Npdc1Q64322 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Npdc1Q64322 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Npdc1Q64322 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Npdc1Q64322 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Npdc1Q64322 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Npdc1Q64322 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Npdc1Q64322 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms