Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pan3Q640Q5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pan3Q640Q5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pan3Q640Q5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pan3Q640Q5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pan3Q640Q5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pan3Q640Q5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pan3Q640Q5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pan3Q640Q5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pan3Q640Q5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pan3Q640Q5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pan3Q640Q5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pan3Q640Q5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pan3Q640Q5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pan3Q640Q5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pan3Q640Q5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pan3Q640Q5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pan3Q640Q5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pan3Q640Q5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pan3Q640Q5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pan3Q640Q5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pan3Q640Q5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pan3Q640Q5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pan3Q640Q5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pan3Q640Q5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pan3Q640Q5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pan3Q640Q5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pan3Q640Q5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pan3Q640Q5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pan3Q640Q5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pan3Q640Q5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pan3Q640Q5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pan3Q640Q5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pan3Q640Q5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pan3Q640Q5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pan3Q640Q5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pan3Q640Q5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pan3Q640Q5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pan3Q640Q5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pan3Q640Q5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pan3Q640Q5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pan3Q640Q5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pan3Q640Q5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pan3Q640Q5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pan3Q640Q5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pan3Q640Q5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pan3Q640Q5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pan3Q640Q5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pan3Q640Q5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pan3Q640Q5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pan3Q640Q5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pan3Q640Q5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pan3Q640Q5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pan3Q640Q5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pan3Q640Q5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pan3Q640Q5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pan3Q640Q5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pan3Q640Q5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pan3Q640Q5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pan3Q640Q5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pan3Q640Q5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pan3Q640Q5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pan3Q640Q5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pan3Q640Q5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pan3Q640Q5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pan3Q640Q5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pan3Q640Q5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pan3Q640Q5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pan3Q640Q5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pan3Q640Q5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pan3Q640Q5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pan3Q640Q5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pan3Q640Q5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pan3Q640Q5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pan3Q640Q5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pan3Q640Q5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pan3Q640Q5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pan3Q640Q5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pan3Q640Q5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pan3Q640Q5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pan3Q640Q5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pan3Q640Q5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pan3Q640Q5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pan3Q640Q5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pan3Q640Q5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pan3Q640Q5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pan3Q640Q5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pan3Q640Q5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pan3Q640Q5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pan3Q640Q5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pan3Q640Q5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pan3Q640Q5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pan3Q640Q5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pan3Q640Q5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pan3Q640Q5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pan3Q640Q5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pan3Q640Q5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pan3Q640Q5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pan3Q640Q5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pan3Q640Q5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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