Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms