Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou4f3Q63955 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou4f3Q63955 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou4f3Q63955 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou4f3Q63955 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou4f3Q63955 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou4f3Q63955 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou4f3Q63955 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou4f3Q63955 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou4f3Q63955 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou4f3Q63955 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou4f3Q63955 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou4f3Q63955 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou4f3Q63955 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou4f3Q63955 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou4f3Q63955 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou4f3Q63955 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou4f3Q63955 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou4f3Q63955 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou4f3Q63955 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
Pou4f3Q63955 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Pou4f3Q63955 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou4f3Q63955 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou4f3Q63955 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou4f3Q63955 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou4f3Q63955 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou4f3Q63955 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou4f3Q63955 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou4f3Q63955 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou4f3Q63955 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou4f3Q63955 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou4f3Q63955 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou4f3Q63955 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou4f3Q63955 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou4f3Q63955 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou4f3Q63955 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou4f3Q63955 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou4f3Q63955 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou4f3Q63955 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou4f3Q63955 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou4f3Q63955 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou4f3Q63955 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou4f3Q63955 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou4f3Q63955 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou4f3Q63955 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou4f3Q63955 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou4f3Q63955 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou4f3Q63955 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou4f3Q63955 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou4f3Q63955 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou4f3Q63955 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou4f3Q63955 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou4f3Q63955 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou4f3Q63955 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou4f3Q63955 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou4f3Q63955 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou4f3Q63955 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou4f3Q63955 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou4f3Q63955 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
Pou4f3Q63955 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou4f3Q63955 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou4f3Q63955 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou4f3Q63955 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou4f3Q63955 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou4f3Q63955 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou4f3Q63955 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou4f3Q63955 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou4f3Q63955 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou4f3Q63955 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou4f3Q63955 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou4f3Q63955 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou4f3Q63955 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou4f3Q63955 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou4f3Q63955 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pou4f3Q63955 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pou4f3Q63955 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pou4f3Q63955 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pou4f3Q63955 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pou4f3Q63955 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pou4f3Q63955 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Pou4f3Q63955 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou4f3Q63955 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou4f3Q63955 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou4f3Q63955 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou4f3Q63955 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou4f3Q63955 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou4f3Q63955 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou4f3Q63955 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou4f3Q63955 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou4f3Q63955 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pou4f3Q63955 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pou4f3Q63955 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Pou4f3Q63955 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pou4f3Q63955 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Pou4f3Q63955 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pou4f3Q63955 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pou4f3Q63955 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pou4f3Q63955 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pou4f3Q63955 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pou4f3Q63955 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms