Protein–RNA interactions for Protein: Q62191

Trim21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim21Q62191 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim21Q62191 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim21Q62191 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim21Q62191 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim21Q62191 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim21Q62191 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim21Q62191 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim21Q62191 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim21Q62191 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim21Q62191 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim21Q62191 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim21Q62191 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim21Q62191 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim21Q62191 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim21Q62191 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim21Q62191 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim21Q62191 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim21Q62191 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim21Q62191 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim21Q62191 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim21Q62191 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim21Q62191 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim21Q62191 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim21Q62191 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim21Q62191 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim21Q62191 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim21Q62191 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim21Q62191 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim21Q62191 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim21Q62191 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim21Q62191 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim21Q62191 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim21Q62191 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim21Q62191 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim21Q62191 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim21Q62191 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim21Q62191 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim21Q62191 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim21Q62191 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim21Q62191 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim21Q62191 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim21Q62191 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim21Q62191 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim21Q62191 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim21Q62191 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim21Q62191 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim21Q62191 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim21Q62191 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim21Q62191 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim21Q62191 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim21Q62191 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim21Q62191 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim21Q62191 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim21Q62191 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim21Q62191 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim21Q62191 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim21Q62191 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim21Q62191 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim21Q62191 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.3 ms