Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ttf1Q62187 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttf1Q62187 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttf1Q62187 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttf1Q62187 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttf1Q62187 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttf1Q62187 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttf1Q62187 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttf1Q62187 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttf1Q62187 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttf1Q62187 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttf1Q62187 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttf1Q62187 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttf1Q62187 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttf1Q62187 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttf1Q62187 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttf1Q62187 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttf1Q62187 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttf1Q62187 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttf1Q62187 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttf1Q62187 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttf1Q62187 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttf1Q62187 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttf1Q62187 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttf1Q62187 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttf1Q62187 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttf1Q62187 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttf1Q62187 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttf1Q62187 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttf1Q62187 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttf1Q62187 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttf1Q62187 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttf1Q62187 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttf1Q62187 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttf1Q62187 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttf1Q62187 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ttf1Q62187 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ttf1Q62187 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ttf1Q62187 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttf1Q62187 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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Ttf1Q62187 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttf1Q62187 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttf1Q62187 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttf1Q62187 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttf1Q62187 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttf1Q62187 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttf1Q62187 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttf1Q62187 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttf1Q62187 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttf1Q62187 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttf1Q62187 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttf1Q62187 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttf1Q62187 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttf1Q62187 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttf1Q62187 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttf1Q62187 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttf1Q62187 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttf1Q62187 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttf1Q62187 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttf1Q62187 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttf1Q62187 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttf1Q62187 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttf1Q62187 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttf1Q62187 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttf1Q62187 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttf1Q62187 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttf1Q62187 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttf1Q62187 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttf1Q62187 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttf1Q62187 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttf1Q62187 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttf1Q62187 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttf1Q62187 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttf1Q62187 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttf1Q62187 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttf1Q62187 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143 ms