Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema3cQ62181 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema3cQ62181 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema3cQ62181 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema3cQ62181 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema3cQ62181 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema3cQ62181 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema3cQ62181 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema3cQ62181 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema3cQ62181 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema3cQ62181 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema3cQ62181 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema3cQ62181 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema3cQ62181 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema3cQ62181 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sema3cQ62181 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema3cQ62181 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema3cQ62181 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema3cQ62181 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema3cQ62181 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema3cQ62181 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema3cQ62181 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema3cQ62181 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema3cQ62181 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema3cQ62181 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema3cQ62181 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema3cQ62181 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema3cQ62181 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema3cQ62181 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema3cQ62181 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema3cQ62181 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema3cQ62181 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema3cQ62181 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema3cQ62181 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema3cQ62181 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema3cQ62181 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema3cQ62181 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema3cQ62181 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema3cQ62181 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema3cQ62181 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema3cQ62181 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema3cQ62181 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema3cQ62181 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema3cQ62181 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema3cQ62181 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema3cQ62181 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema3cQ62181 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema3cQ62181 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema3cQ62181 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sema3cQ62181 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sema3cQ62181 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema3cQ62181 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema3cQ62181 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema3cQ62181 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema3cQ62181 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema3cQ62181 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema3cQ62181 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema3cQ62181 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema3cQ62181 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema3cQ62181 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema3cQ62181 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema3cQ62181 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema3cQ62181 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema3cQ62181 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema3cQ62181 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema3cQ62181 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema3cQ62181 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema3cQ62181 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema3cQ62181 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema3cQ62181 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema3cQ62181 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema3cQ62181 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema3cQ62181 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Sema3cQ62181 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema3cQ62181 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema3cQ62181 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema3cQ62181 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema3cQ62181 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema3cQ62181 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema3cQ62181 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema3cQ62181 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema3cQ62181 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sema3cQ62181 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema3cQ62181 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema3cQ62181 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema3cQ62181 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema3cQ62181 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema3cQ62181 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema3cQ62181 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema3cQ62181 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema3cQ62181 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema3cQ62181 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema3cQ62181 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema3cQ62181 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema3cQ62181 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema3cQ62181 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema3cQ62181 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema3cQ62181 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema3cQ62181 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema3cQ62181 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms