Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprrQ62132 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprrQ62132 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprrQ62132 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprrQ62132 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprrQ62132 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprrQ62132 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprrQ62132 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprrQ62132 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprrQ62132 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprrQ62132 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprrQ62132 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PtprrQ62132 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PtprrQ62132 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PtprrQ62132 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprrQ62132 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprrQ62132 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprrQ62132 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprrQ62132 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprrQ62132 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprrQ62132 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprrQ62132 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprrQ62132 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprrQ62132 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprrQ62132 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprrQ62132 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprrQ62132 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprrQ62132 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprrQ62132 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprrQ62132 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprrQ62132 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprrQ62132 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprrQ62132 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprrQ62132 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprrQ62132 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprrQ62132 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprrQ62132 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprrQ62132 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprrQ62132 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprrQ62132 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprrQ62132 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprrQ62132 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprrQ62132 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprrQ62132 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprrQ62132 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprrQ62132 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprrQ62132 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprrQ62132 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprrQ62132 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprrQ62132 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprrQ62132 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprrQ62132 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprrQ62132 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprrQ62132 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprrQ62132 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprrQ62132 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprrQ62132 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprrQ62132 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprrQ62132 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprrQ62132 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprrQ62132 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprrQ62132 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprrQ62132 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprrQ62132 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprrQ62132 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprrQ62132 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprrQ62132 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprrQ62132 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprrQ62132 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprrQ62132 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprrQ62132 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprrQ62132 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprrQ62132 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprrQ62132 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprrQ62132 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprrQ62132 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprrQ62132 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprrQ62132 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprrQ62132 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprrQ62132 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PtprrQ62132 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprrQ62132 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprrQ62132 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprrQ62132 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprrQ62132 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprrQ62132 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprrQ62132 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprrQ62132 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprrQ62132 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprrQ62132 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprrQ62132 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprrQ62132 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprrQ62132 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprrQ62132 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprrQ62132 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprrQ62132 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprrQ62132 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprrQ62132 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprrQ62132 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprrQ62132 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
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