Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf1Q61999 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf1Q61999 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf1Q61999 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf1Q61999 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf1Q61999 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf1Q61999 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf1Q61999 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf1Q61999 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf1Q61999 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf1Q61999 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf1Q61999 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf1Q61999 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf1Q61999 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf1Q61999 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf1Q61999 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf1Q61999 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf1Q61999 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf1Q61999 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf1Q61999 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf1Q61999 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf1Q61999 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf1Q61999 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf1Q61999 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf1Q61999 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf1Q61999 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf1Q61999 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf1Q61999 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf1Q61999 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf1Q61999 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf1Q61999 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Odf1Q61999 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Odf1Q61999 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf1Q61999 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms