Protein–RNA interactions for Protein: Q61818

Rai1, Retinoic acid-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai1Q61818 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rai1Q61818 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rai1Q61818 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rai1Q61818 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rai1Q61818 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rai1Q61818 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rai1Q61818 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rai1Q61818 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rai1Q61818 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rai1Q61818 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rai1Q61818 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rai1Q61818 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rai1Q61818 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rai1Q61818 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rai1Q61818 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rai1Q61818 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rai1Q61818 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rai1Q61818 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rai1Q61818 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rai1Q61818 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rai1Q61818 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rai1Q61818 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rai1Q61818 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rai1Q61818 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rai1Q61818 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rai1Q61818 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rai1Q61818 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rai1Q61818 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rai1Q61818 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rai1Q61818 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rai1Q61818 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rai1Q61818 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rai1Q61818 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rai1Q61818 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rai1Q61818 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rai1Q61818 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rai1Q61818 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rai1Q61818 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rai1Q61818 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rai1Q61818 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rai1Q61818 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rai1Q61818 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rai1Q61818 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rai1Q61818 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rai1Q61818 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rai1Q61818 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rai1Q61818 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rai1Q61818 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rai1Q61818 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rai1Q61818 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rai1Q61818 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rai1Q61818 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rai1Q61818 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rai1Q61818 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rai1Q61818 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rai1Q61818 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rai1Q61818 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rai1Q61818 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rai1Q61818 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rai1Q61818 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rai1Q61818 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rai1Q61818 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rai1Q61818 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rai1Q61818 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rai1Q61818 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rai1Q61818 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rai1Q61818 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rai1Q61818 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rai1Q61818 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rai1Q61818 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rai1Q61818 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rai1Q61818 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rai1Q61818 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rai1Q61818 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rai1Q61818 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rai1Q61818 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rai1Q61818 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rai1Q61818 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rai1Q61818 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rai1Q61818 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rai1Q61818 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rai1Q61818 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rai1Q61818 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rai1Q61818 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rai1Q61818 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rai1Q61818 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rai1Q61818 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rai1Q61818 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rai1Q61818 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rai1Q61818 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rai1Q61818 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rai1Q61818 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rai1Q61818 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rai1Q61818 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rai1Q61818 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rai1Q61818 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rai1Q61818 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rai1Q61818 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rai1Q61818 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rai1Q61818 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.1 ms