Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ecm1Q61508 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ecm1Q61508 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ecm1Q61508 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ecm1Q61508 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ecm1Q61508 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ecm1Q61508 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ecm1Q61508 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ecm1Q61508 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ecm1Q61508 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ecm1Q61508 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ecm1Q61508 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ecm1Q61508 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ecm1Q61508 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ecm1Q61508 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ecm1Q61508 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ecm1Q61508 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ecm1Q61508 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ecm1Q61508 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ecm1Q61508 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ecm1Q61508 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ecm1Q61508 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ecm1Q61508 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ecm1Q61508 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ecm1Q61508 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ecm1Q61508 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ecm1Q61508 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ecm1Q61508 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ecm1Q61508 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ecm1Q61508 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ecm1Q61508 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ecm1Q61508 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ecm1Q61508 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Ecm1Q61508 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ecm1Q61508 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ecm1Q61508 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ecm1Q61508 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ecm1Q61508 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ecm1Q61508 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ecm1Q61508 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ecm1Q61508 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ecm1Q61508 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ecm1Q61508 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ecm1Q61508 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ecm1Q61508 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ecm1Q61508 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ecm1Q61508 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ecm1Q61508 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ecm1Q61508 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ecm1Q61508 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ecm1Q61508 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ecm1Q61508 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ecm1Q61508 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ecm1Q61508 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ecm1Q61508 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ecm1Q61508 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ecm1Q61508 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ecm1Q61508 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ecm1Q61508 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ecm1Q61508 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ecm1Q61508 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ecm1Q61508 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ecm1Q61508 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ecm1Q61508 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ecm1Q61508 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ecm1Q61508 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ecm1Q61508 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ecm1Q61508 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ecm1Q61508 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ecm1Q61508 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ecm1Q61508 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ecm1Q61508 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ecm1Q61508 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ecm1Q61508 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ecm1Q61508 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ecm1Q61508 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ecm1Q61508 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ecm1Q61508 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ecm1Q61508 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ecm1Q61508 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ecm1Q61508 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ecm1Q61508 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ecm1Q61508 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ecm1Q61508 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ecm1Q61508 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ecm1Q61508 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ecm1Q61508 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ecm1Q61508 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ecm1Q61508 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ecm1Q61508 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ecm1Q61508 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ecm1Q61508 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ecm1Q61508 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ecm1Q61508 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ecm1Q61508 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ecm1Q61508 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ecm1Q61508 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ecm1Q61508 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ecm1Q61508 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ecm1Q61508 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms