Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vsx2Q61412 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vsx2Q61412 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vsx2Q61412 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vsx2Q61412 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vsx2Q61412 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vsx2Q61412 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vsx2Q61412 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vsx2Q61412 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vsx2Q61412 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vsx2Q61412 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vsx2Q61412 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vsx2Q61412 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vsx2Q61412 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vsx2Q61412 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vsx2Q61412 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vsx2Q61412 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vsx2Q61412 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vsx2Q61412 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vsx2Q61412 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vsx2Q61412 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vsx2Q61412 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vsx2Q61412 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Vsx2Q61412 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms