Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cln3Q61124 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cln3Q61124 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cln3Q61124 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cln3Q61124 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cln3Q61124 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cln3Q61124 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cln3Q61124 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cln3Q61124 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cln3Q61124 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cln3Q61124 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cln3Q61124 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cln3Q61124 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cln3Q61124 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cln3Q61124 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cln3Q61124 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cln3Q61124 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cln3Q61124 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cln3Q61124 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cln3Q61124 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cln3Q61124 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cln3Q61124 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cln3Q61124 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cln3Q61124 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cln3Q61124 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cln3Q61124 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cln3Q61124 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cln3Q61124 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cln3Q61124 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cln3Q61124 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cln3Q61124 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cln3Q61124 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cln3Q61124 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cln3Q61124 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cln3Q61124 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cln3Q61124 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cln3Q61124 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cln3Q61124 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cln3Q61124 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cln3Q61124 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cln3Q61124 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cln3Q61124 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cln3Q61124 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cln3Q61124 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cln3Q61124 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cln3Q61124 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cln3Q61124 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cln3Q61124 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cln3Q61124 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cln3Q61124 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cln3Q61124 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cln3Q61124 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cln3Q61124 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cln3Q61124 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cln3Q61124 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cln3Q61124 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cln3Q61124 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cln3Q61124 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cln3Q61124 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cln3Q61124 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cln3Q61124 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cln3Q61124 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cln3Q61124 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cln3Q61124 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cln3Q61124 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cln3Q61124 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cln3Q61124 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cln3Q61124 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cln3Q61124 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cln3Q61124 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cln3Q61124 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cln3Q61124 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cln3Q61124 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cln3Q61124 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cln3Q61124 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cln3Q61124 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cln3Q61124 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cln3Q61124 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cln3Q61124 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cln3Q61124 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cln3Q61124 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cln3Q61124 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cln3Q61124 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cln3Q61124 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cln3Q61124 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cln3Q61124 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cln3Q61124 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cln3Q61124 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cln3Q61124 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cln3Q61124 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cln3Q61124 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cln3Q61124 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cln3Q61124 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cln3Q61124 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cln3Q61124 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cln3Q61124 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cln3Q61124 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cln3Q61124 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cln3Q61124 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cln3Q61124 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.1 ms