Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbbp7Q60973 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbbp7Q60973 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbbp7Q60973 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbbp7Q60973 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbbp7Q60973 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbbp7Q60973 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbbp7Q60973 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbbp7Q60973 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbbp7Q60973 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbbp7Q60973 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbbp7Q60973 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbbp7Q60973 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbbp7Q60973 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbbp7Q60973 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbbp7Q60973 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbbp7Q60973 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbbp7Q60973 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbbp7Q60973 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbbp7Q60973 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbbp7Q60973 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbbp7Q60973 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbbp7Q60973 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbbp7Q60973 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbbp7Q60973 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rbbp7Q60973 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rbbp7Q60973 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbbp7Q60973 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbbp7Q60973 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbbp7Q60973 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbbp7Q60973 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbbp7Q60973 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbbp7Q60973 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbbp7Q60973 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbbp7Q60973 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbbp7Q60973 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbbp7Q60973 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbbp7Q60973 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbbp7Q60973 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbbp7Q60973 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbbp7Q60973 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbbp7Q60973 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbbp7Q60973 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbbp7Q60973 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbbp7Q60973 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbbp7Q60973 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbbp7Q60973 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbbp7Q60973 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbbp7Q60973 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbbp7Q60973 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbbp7Q60973 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbbp7Q60973 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbbp7Q60973 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbbp7Q60973 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbbp7Q60973 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbbp7Q60973 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbbp7Q60973 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbbp7Q60973 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbbp7Q60973 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbbp7Q60973 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbbp7Q60973 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbbp7Q60973 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbbp7Q60973 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbbp7Q60973 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbbp7Q60973 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbbp7Q60973 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbbp7Q60973 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbbp7Q60973 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbbp7Q60973 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbbp7Q60973 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbbp7Q60973 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbbp7Q60973 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbbp7Q60973 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbbp7Q60973 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbbp7Q60973 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbbp7Q60973 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbbp7Q60973 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbbp7Q60973 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbbp7Q60973 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbbp7Q60973 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbbp7Q60973 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbbp7Q60973 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbbp7Q60973 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbbp7Q60973 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbbp7Q60973 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbbp7Q60973 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbbp7Q60973 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbbp7Q60973 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbbp7Q60973 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rbbp7Q60973 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rbbp7Q60973 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rbbp7Q60973 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rbbp7Q60973 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rbbp7Q60973 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbbp7Q60973 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbbp7Q60973 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbbp7Q60973 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbbp7Q60973 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbbp7Q60973 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbbp7Q60973 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms