Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Sin3aQ60520 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Sin3aQ60520 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Sin3aQ60520 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Sin3aQ60520 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Sin3aQ60520 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Sin3aQ60520 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Sin3aQ60520 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Sin3aQ60520 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Sin3aQ60520 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Sin3aQ60520 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Sin3aQ60520 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Sin3aQ60520 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Sin3aQ60520 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Sin3aQ60520 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Sin3aQ60520 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Sin3aQ60520 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Sin3aQ60520 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Sin3aQ60520 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Sin3aQ60520 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Sin3aQ60520 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Sin3aQ60520 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Sin3aQ60520 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Sin3aQ60520 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Sin3aQ60520 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Sin3aQ60520 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
Sin3aQ60520 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Sin3aQ60520 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Sin3aQ60520 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Sin3aQ60520 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Sin3aQ60520 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Sin3aQ60520 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Sin3aQ60520 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Sin3aQ60520 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Sin3aQ60520 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Sin3aQ60520 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Sin3aQ60520 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Sin3aQ60520 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Sin3aQ60520 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Sin3aQ60520 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Sin3aQ60520 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Sin3aQ60520 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Sin3aQ60520 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Sin3aQ60520 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Sin3aQ60520 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Sin3aQ60520 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Sin3aQ60520 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Sin3aQ60520 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Sin3aQ60520 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Sin3aQ60520 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Sin3aQ60520 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Sin3aQ60520 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Sin3aQ60520 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Sin3aQ60520 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Sin3aQ60520 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Sin3aQ60520 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Sin3aQ60520 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Sin3aQ60520 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Sin3aQ60520 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Sin3aQ60520 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Sin3aQ60520 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Sin3aQ60520 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Sin3aQ60520 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Sin3aQ60520 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Sin3aQ60520 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Sin3aQ60520 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Sin3aQ60520 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Sin3aQ60520 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Sin3aQ60520 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Sin3aQ60520 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Sin3aQ60520 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Sin3aQ60520 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Sin3aQ60520 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Sin3aQ60520 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Sin3aQ60520 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Sin3aQ60520 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Sin3aQ60520 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Sin3aQ60520 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Sin3aQ60520 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Sin3aQ60520 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Sin3aQ60520 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Sin3aQ60520 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Sin3aQ60520 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Sin3aQ60520 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Sin3aQ60520 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Sin3aQ60520 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Sin3aQ60520 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Sin3aQ60520 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Sin3aQ60520 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Sin3aQ60520 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Sin3aQ60520 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Sin3aQ60520 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Sin3aQ60520 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Sin3aQ60520 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Sin3aQ60520 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Sin3aQ60520 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Sin3aQ60520 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Sin3aQ60520 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Sin3aQ60520 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Sin3aQ60520 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms