Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJY5

Arcn1, Coatomer subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arcn1Q5XJY5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arcn1Q5XJY5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arcn1Q5XJY5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arcn1Q5XJY5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arcn1Q5XJY5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arcn1Q5XJY5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arcn1Q5XJY5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arcn1Q5XJY5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arcn1Q5XJY5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arcn1Q5XJY5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arcn1Q5XJY5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arcn1Q5XJY5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arcn1Q5XJY5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Arcn1Q5XJY5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arcn1Q5XJY5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arcn1Q5XJY5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arcn1Q5XJY5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arcn1Q5XJY5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arcn1Q5XJY5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arcn1Q5XJY5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arcn1Q5XJY5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arcn1Q5XJY5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arcn1Q5XJY5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arcn1Q5XJY5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arcn1Q5XJY5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arcn1Q5XJY5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Arcn1Q5XJY5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Arcn1Q5XJY5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arcn1Q5XJY5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arcn1Q5XJY5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arcn1Q5XJY5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arcn1Q5XJY5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arcn1Q5XJY5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arcn1Q5XJY5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arcn1Q5XJY5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arcn1Q5XJY5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arcn1Q5XJY5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arcn1Q5XJY5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arcn1Q5XJY5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arcn1Q5XJY5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arcn1Q5XJY5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arcn1Q5XJY5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Arcn1Q5XJY5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arcn1Q5XJY5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arcn1Q5XJY5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arcn1Q5XJY5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arcn1Q5XJY5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arcn1Q5XJY5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arcn1Q5XJY5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arcn1Q5XJY5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arcn1Q5XJY5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arcn1Q5XJY5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arcn1Q5XJY5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Arcn1Q5XJY5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arcn1Q5XJY5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arcn1Q5XJY5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arcn1Q5XJY5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arcn1Q5XJY5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arcn1Q5XJY5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arcn1Q5XJY5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arcn1Q5XJY5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arcn1Q5XJY5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arcn1Q5XJY5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arcn1Q5XJY5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arcn1Q5XJY5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Arcn1Q5XJY5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arcn1Q5XJY5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arcn1Q5XJY5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arcn1Q5XJY5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Arcn1Q5XJY5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arcn1Q5XJY5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arcn1Q5XJY5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arcn1Q5XJY5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arcn1Q5XJY5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arcn1Q5XJY5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arcn1Q5XJY5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arcn1Q5XJY5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arcn1Q5XJY5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arcn1Q5XJY5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arcn1Q5XJY5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arcn1Q5XJY5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arcn1Q5XJY5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arcn1Q5XJY5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arcn1Q5XJY5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arcn1Q5XJY5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arcn1Q5XJY5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arcn1Q5XJY5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arcn1Q5XJY5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arcn1Q5XJY5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arcn1Q5XJY5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arcn1Q5XJY5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arcn1Q5XJY5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Arcn1Q5XJY5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arcn1Q5XJY5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arcn1Q5XJY5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arcn1Q5XJY5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arcn1Q5XJY5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arcn1Q5XJY5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arcn1Q5XJY5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Arcn1Q5XJY5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms