Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r195Q5SVD6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r195Q5SVD6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r195Q5SVD6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r195Q5SVD6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r195Q5SVD6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r195Q5SVD6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r195Q5SVD6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r195Q5SVD6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r195Q5SVD6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r195Q5SVD6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r195Q5SVD6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r195Q5SVD6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r195Q5SVD6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r195Q5SVD6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r195Q5SVD6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r195Q5SVD6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r195Q5SVD6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r195Q5SVD6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r195Q5SVD6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r195Q5SVD6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r195Q5SVD6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r195Q5SVD6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r195Q5SVD6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r195Q5SVD6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r195Q5SVD6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r195Q5SVD6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r195Q5SVD6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r195Q5SVD6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r195Q5SVD6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r195Q5SVD6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r195Q5SVD6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms