Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Psme4Q5SSW2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Psme4Q5SSW2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Psme4Q5SSW2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Psme4Q5SSW2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Psme4Q5SSW2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Psme4Q5SSW2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Psme4Q5SSW2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Psme4Q5SSW2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Psme4Q5SSW2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Psme4Q5SSW2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Psme4Q5SSW2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Psme4Q5SSW2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Psme4Q5SSW2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Psme4Q5SSW2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Psme4Q5SSW2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Psme4Q5SSW2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Psme4Q5SSW2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Psme4Q5SSW2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Psme4Q5SSW2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Psme4Q5SSW2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Psme4Q5SSW2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Psme4Q5SSW2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Psme4Q5SSW2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Psme4Q5SSW2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Psme4Q5SSW2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Psme4Q5SSW2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Psme4Q5SSW2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Psme4Q5SSW2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Psme4Q5SSW2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Psme4Q5SSW2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Psme4Q5SSW2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Psme4Q5SSW2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Psme4Q5SSW2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Psme4Q5SSW2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Psme4Q5SSW2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Psme4Q5SSW2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Psme4Q5SSW2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Psme4Q5SSW2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Psme4Q5SSW2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Psme4Q5SSW2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Psme4Q5SSW2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Psme4Q5SSW2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Psme4Q5SSW2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Psme4Q5SSW2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Psme4Q5SSW2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Psme4Q5SSW2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Psme4Q5SSW2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Psme4Q5SSW2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Psme4Q5SSW2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Psme4Q5SSW2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Psme4Q5SSW2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Psme4Q5SSW2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Psme4Q5SSW2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Psme4Q5SSW2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Psme4Q5SSW2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Psme4Q5SSW2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Psme4Q5SSW2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Psme4Q5SSW2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Psme4Q5SSW2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Psme4Q5SSW2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Psme4Q5SSW2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Psme4Q5SSW2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Psme4Q5SSW2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Psme4Q5SSW2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Psme4Q5SSW2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Psme4Q5SSW2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Psme4Q5SSW2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Psme4Q5SSW2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Psme4Q5SSW2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Psme4Q5SSW2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Psme4Q5SSW2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Psme4Q5SSW2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Psme4Q5SSW2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Psme4Q5SSW2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Psme4Q5SSW2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Psme4Q5SSW2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Psme4Q5SSW2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Psme4Q5SSW2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Psme4Q5SSW2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Psme4Q5SSW2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Psme4Q5SSW2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Psme4Q5SSW2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Psme4Q5SSW2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Psme4Q5SSW2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Psme4Q5SSW2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Psme4Q5SSW2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Psme4Q5SSW2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Psme4Q5SSW2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Psme4Q5SSW2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Psme4Q5SSW2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Psme4Q5SSW2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Psme4Q5SSW2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Psme4Q5SSW2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Psme4Q5SSW2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Psme4Q5SSW2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Psme4Q5SSW2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Psme4Q5SSW2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Psme4Q5SSW2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Psme4Q5SSW2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms