Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPV6

Uncharacterized protein C2orf73 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5SPV6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q5SPV6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q5SPV6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q5SPV6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Q5SPV6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q5SPV6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q5SPV6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q5SPV6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q5SPV6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q5SPV6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q5SPV6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Q5SPV6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q5SPV6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Q5SPV6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Q5SPV6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q5SPV6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Q5SPV6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q5SPV6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q5SPV6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q5SPV6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q5SPV6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q5SPV6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q5SPV6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q5SPV6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q5SPV6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q5SPV6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q5SPV6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q5SPV6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q5SPV6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q5SPV6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q5SPV6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q5SPV6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q5SPV6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q5SPV6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q5SPV6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q5SPV6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q5SPV6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q5SPV6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q5SPV6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q5SPV6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q5SPV6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q5SPV6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q5SPV6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q5SPV6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q5SPV6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q5SPV6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q5SPV6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q5SPV6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q5SPV6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q5SPV6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Q5SPV6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q5SPV6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q5SPV6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Q5SPV6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q5SPV6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q5SPV6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q5SPV6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q5SPV6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q5SPV6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q5SPV6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q5SPV6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q5SPV6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q5SPV6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q5SPV6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q5SPV6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q5SPV6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q5SPV6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q5SPV6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q5SPV6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q5SPV6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q5SPV6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q5SPV6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q5SPV6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Q5SPV6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Q5SPV6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q5SPV6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q5SPV6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q5SPV6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q5SPV6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q5SPV6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q5SPV6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q5SPV6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q5SPV6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q5SPV6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q5SPV6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q5SPV6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q5SPV6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q5SPV6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q5SPV6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q5SPV6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q5SPV6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q5SPV6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q5SPV6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q5SPV6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q5SPV6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q5SPV6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q5SPV6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q5SPV6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q5SPV6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Q5SPV6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms