Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scarf1Q5ND28 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scarf1Q5ND28 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scarf1Q5ND28 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scarf1Q5ND28 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scarf1Q5ND28 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scarf1Q5ND28 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scarf1Q5ND28 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Scarf1Q5ND28 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Scarf1Q5ND28 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scarf1Q5ND28 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scarf1Q5ND28 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scarf1Q5ND28 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scarf1Q5ND28 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scarf1Q5ND28 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Scarf1Q5ND28 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scarf1Q5ND28 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scarf1Q5ND28 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Scarf1Q5ND28 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scarf1Q5ND28 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scarf1Q5ND28 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Scarf1Q5ND28 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scarf1Q5ND28 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scarf1Q5ND28 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scarf1Q5ND28 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scarf1Q5ND28 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scarf1Q5ND28 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scarf1Q5ND28 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scarf1Q5ND28 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scarf1Q5ND28 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scarf1Q5ND28 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scarf1Q5ND28 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scarf1Q5ND28 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scarf1Q5ND28 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scarf1Q5ND28 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scarf1Q5ND28 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scarf1Q5ND28 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Scarf1Q5ND28 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Scarf1Q5ND28 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scarf1Q5ND28 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scarf1Q5ND28 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scarf1Q5ND28 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scarf1Q5ND28 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scarf1Q5ND28 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scarf1Q5ND28 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scarf1Q5ND28 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scarf1Q5ND28 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scarf1Q5ND28 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scarf1Q5ND28 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scarf1Q5ND28 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scarf1Q5ND28 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scarf1Q5ND28 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scarf1Q5ND28 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scarf1Q5ND28 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scarf1Q5ND28 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scarf1Q5ND28 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scarf1Q5ND28 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scarf1Q5ND28 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scarf1Q5ND28 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scarf1Q5ND28 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scarf1Q5ND28 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scarf1Q5ND28 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scarf1Q5ND28 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scarf1Q5ND28 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scarf1Q5ND28 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scarf1Q5ND28 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scarf1Q5ND28 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scarf1Q5ND28 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scarf1Q5ND28 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scarf1Q5ND28 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scarf1Q5ND28 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scarf1Q5ND28 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scarf1Q5ND28 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scarf1Q5ND28 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scarf1Q5ND28 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scarf1Q5ND28 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scarf1Q5ND28 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scarf1Q5ND28 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Scarf1Q5ND28 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Scarf1Q5ND28 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scarf1Q5ND28 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scarf1Q5ND28 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scarf1Q5ND28 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scarf1Q5ND28 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scarf1Q5ND28 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scarf1Q5ND28 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scarf1Q5ND28 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scarf1Q5ND28 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scarf1Q5ND28 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scarf1Q5ND28 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scarf1Q5ND28 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scarf1Q5ND28 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Scarf1Q5ND28 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scarf1Q5ND28 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scarf1Q5ND28 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scarf1Q5ND28 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scarf1Q5ND28 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scarf1Q5ND28 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scarf1Q5ND28 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scarf1Q5ND28 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms