Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc1Q5NCF2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc1Q5NCF2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc1Q5NCF2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc1Q5NCF2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc1Q5NCF2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc1Q5NCF2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc1Q5NCF2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc1Q5NCF2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc1Q5NCF2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc1Q5NCF2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc1Q5NCF2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc1Q5NCF2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc1Q5NCF2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc1Q5NCF2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc1Q5NCF2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc1Q5NCF2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc1Q5NCF2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc1Q5NCF2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc1Q5NCF2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc1Q5NCF2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc1Q5NCF2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc1Q5NCF2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc1Q5NCF2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc1Q5NCF2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc1Q5NCF2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc1Q5NCF2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc1Q5NCF2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc1Q5NCF2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc1Q5NCF2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc1Q5NCF2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc1Q5NCF2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc1Q5NCF2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc1Q5NCF2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc1Q5NCF2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc1Q5NCF2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc1Q5NCF2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms