Protein–RNA interactions for Protein: Q5M6W3

Clhc1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clhc1Q5M6W3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clhc1Q5M6W3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clhc1Q5M6W3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clhc1Q5M6W3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clhc1Q5M6W3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clhc1Q5M6W3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clhc1Q5M6W3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clhc1Q5M6W3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clhc1Q5M6W3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clhc1Q5M6W3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clhc1Q5M6W3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clhc1Q5M6W3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clhc1Q5M6W3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clhc1Q5M6W3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clhc1Q5M6W3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clhc1Q5M6W3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clhc1Q5M6W3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clhc1Q5M6W3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clhc1Q5M6W3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clhc1Q5M6W3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clhc1Q5M6W3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clhc1Q5M6W3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clhc1Q5M6W3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clhc1Q5M6W3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clhc1Q5M6W3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clhc1Q5M6W3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clhc1Q5M6W3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clhc1Q5M6W3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clhc1Q5M6W3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clhc1Q5M6W3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clhc1Q5M6W3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clhc1Q5M6W3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clhc1Q5M6W3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clhc1Q5M6W3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clhc1Q5M6W3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clhc1Q5M6W3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clhc1Q5M6W3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clhc1Q5M6W3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clhc1Q5M6W3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clhc1Q5M6W3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clhc1Q5M6W3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clhc1Q5M6W3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clhc1Q5M6W3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clhc1Q5M6W3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Clhc1Q5M6W3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clhc1Q5M6W3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clhc1Q5M6W3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clhc1Q5M6W3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clhc1Q5M6W3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clhc1Q5M6W3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clhc1Q5M6W3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clhc1Q5M6W3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clhc1Q5M6W3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clhc1Q5M6W3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clhc1Q5M6W3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clhc1Q5M6W3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clhc1Q5M6W3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clhc1Q5M6W3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clhc1Q5M6W3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clhc1Q5M6W3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clhc1Q5M6W3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clhc1Q5M6W3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clhc1Q5M6W3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clhc1Q5M6W3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clhc1Q5M6W3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clhc1Q5M6W3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clhc1Q5M6W3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clhc1Q5M6W3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clhc1Q5M6W3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clhc1Q5M6W3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clhc1Q5M6W3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Clhc1Q5M6W3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clhc1Q5M6W3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Clhc1Q5M6W3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Clhc1Q5M6W3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clhc1Q5M6W3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clhc1Q5M6W3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Clhc1Q5M6W3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Clhc1Q5M6W3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clhc1Q5M6W3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clhc1Q5M6W3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clhc1Q5M6W3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clhc1Q5M6W3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clhc1Q5M6W3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clhc1Q5M6W3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clhc1Q5M6W3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clhc1Q5M6W3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clhc1Q5M6W3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clhc1Q5M6W3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Clhc1Q5M6W3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clhc1Q5M6W3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clhc1Q5M6W3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clhc1Q5M6W3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clhc1Q5M6W3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clhc1Q5M6W3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clhc1Q5M6W3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clhc1Q5M6W3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clhc1Q5M6W3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Clhc1Q5M6W3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clhc1Q5M6W3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms