Protein–RNA interactions for Protein: Q5IBH7

Spdya, Speedy protein A, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpdyaQ5IBH7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SpdyaQ5IBH7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SpdyaQ5IBH7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SpdyaQ5IBH7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SpdyaQ5IBH7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SpdyaQ5IBH7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SpdyaQ5IBH7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SpdyaQ5IBH7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SpdyaQ5IBH7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SpdyaQ5IBH7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SpdyaQ5IBH7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SpdyaQ5IBH7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SpdyaQ5IBH7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SpdyaQ5IBH7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SpdyaQ5IBH7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SpdyaQ5IBH7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SpdyaQ5IBH7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SpdyaQ5IBH7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SpdyaQ5IBH7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SpdyaQ5IBH7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SpdyaQ5IBH7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SpdyaQ5IBH7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SpdyaQ5IBH7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SpdyaQ5IBH7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SpdyaQ5IBH7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SpdyaQ5IBH7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SpdyaQ5IBH7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SpdyaQ5IBH7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SpdyaQ5IBH7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SpdyaQ5IBH7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SpdyaQ5IBH7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SpdyaQ5IBH7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SpdyaQ5IBH7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SpdyaQ5IBH7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SpdyaQ5IBH7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SpdyaQ5IBH7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SpdyaQ5IBH7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SpdyaQ5IBH7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SpdyaQ5IBH7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SpdyaQ5IBH7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SpdyaQ5IBH7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SpdyaQ5IBH7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SpdyaQ5IBH7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SpdyaQ5IBH7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SpdyaQ5IBH7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SpdyaQ5IBH7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SpdyaQ5IBH7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SpdyaQ5IBH7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SpdyaQ5IBH7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SpdyaQ5IBH7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SpdyaQ5IBH7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SpdyaQ5IBH7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SpdyaQ5IBH7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SpdyaQ5IBH7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SpdyaQ5IBH7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SpdyaQ5IBH7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SpdyaQ5IBH7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SpdyaQ5IBH7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SpdyaQ5IBH7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SpdyaQ5IBH7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SpdyaQ5IBH7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SpdyaQ5IBH7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SpdyaQ5IBH7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SpdyaQ5IBH7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SpdyaQ5IBH7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SpdyaQ5IBH7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SpdyaQ5IBH7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SpdyaQ5IBH7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SpdyaQ5IBH7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SpdyaQ5IBH7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SpdyaQ5IBH7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SpdyaQ5IBH7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SpdyaQ5IBH7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SpdyaQ5IBH7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SpdyaQ5IBH7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SpdyaQ5IBH7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SpdyaQ5IBH7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SpdyaQ5IBH7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SpdyaQ5IBH7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SpdyaQ5IBH7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SpdyaQ5IBH7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SpdyaQ5IBH7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SpdyaQ5IBH7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SpdyaQ5IBH7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SpdyaQ5IBH7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SpdyaQ5IBH7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SpdyaQ5IBH7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SpdyaQ5IBH7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SpdyaQ5IBH7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SpdyaQ5IBH7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SpdyaQ5IBH7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SpdyaQ5IBH7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SpdyaQ5IBH7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SpdyaQ5IBH7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SpdyaQ5IBH7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SpdyaQ5IBH7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SpdyaQ5IBH7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SpdyaQ5IBH7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SpdyaQ5IBH7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SpdyaQ5IBH7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms