Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkaa1Q5EG47 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkaa1Q5EG47 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkaa1Q5EG47 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkaa1Q5EG47 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prkaa1Q5EG47 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prkaa1Q5EG47 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prkaa1Q5EG47 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prkaa1Q5EG47 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prkaa1Q5EG47 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prkaa1Q5EG47 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prkaa1Q5EG47 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prkaa1Q5EG47 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prkaa1Q5EG47 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prkaa1Q5EG47 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prkaa1Q5EG47 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prkaa1Q5EG47 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prkaa1Q5EG47 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prkaa1Q5EG47 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prkaa1Q5EG47 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prkaa1Q5EG47 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prkaa1Q5EG47 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prkaa1Q5EG47 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prkaa1Q5EG47 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prkaa1Q5EG47 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prkaa1Q5EG47 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prkaa1Q5EG47 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prkaa1Q5EG47 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prkaa1Q5EG47 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prkaa1Q5EG47 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prkaa1Q5EG47 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prkaa1Q5EG47 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prkaa1Q5EG47 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prkaa1Q5EG47 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prkaa1Q5EG47 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prkaa1Q5EG47 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prkaa1Q5EG47 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prkaa1Q5EG47 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prkaa1Q5EG47 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prkaa1Q5EG47 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prkaa1Q5EG47 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prkaa1Q5EG47 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkaa1Q5EG47 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkaa1Q5EG47 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkaa1Q5EG47 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkaa1Q5EG47 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkaa1Q5EG47 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkaa1Q5EG47 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkaa1Q5EG47 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkaa1Q5EG47 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkaa1Q5EG47 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkaa1Q5EG47 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkaa1Q5EG47 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkaa1Q5EG47 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkaa1Q5EG47 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkaa1Q5EG47 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkaa1Q5EG47 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkaa1Q5EG47 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prkaa1Q5EG47 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prkaa1Q5EG47 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prkaa1Q5EG47 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prkaa1Q5EG47 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prkaa1Q5EG47 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prkaa1Q5EG47 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prkaa1Q5EG47 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prkaa1Q5EG47 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prkaa1Q5EG47 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkaa1Q5EG47 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkaa1Q5EG47 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkaa1Q5EG47 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkaa1Q5EG47 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkaa1Q5EG47 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkaa1Q5EG47 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkaa1Q5EG47 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkaa1Q5EG47 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prkaa1Q5EG47 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prkaa1Q5EG47 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkaa1Q5EG47 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkaa1Q5EG47 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkaa1Q5EG47 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkaa1Q5EG47 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkaa1Q5EG47 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkaa1Q5EG47 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkaa1Q5EG47 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkaa1Q5EG47 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkaa1Q5EG47 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkaa1Q5EG47 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkaa1Q5EG47 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkaa1Q5EG47 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkaa1Q5EG47 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkaa1Q5EG47 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkaa1Q5EG47 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkaa1Q5EG47 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkaa1Q5EG47 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkaa1Q5EG47 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkaa1Q5EG47 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkaa1Q5EG47 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkaa1Q5EG47 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkaa1Q5EG47 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkaa1Q5EG47 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms