Protein–RNA interactions for Protein: Q571F5

Spsb3, SPRY domain-containing SOCS box protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb3Q571F5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spsb3Q571F5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Spsb3Q571F5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spsb3Q571F5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spsb3Q571F5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spsb3Q571F5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spsb3Q571F5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spsb3Q571F5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spsb3Q571F5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Spsb3Q571F5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Spsb3Q571F5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spsb3Q571F5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spsb3Q571F5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spsb3Q571F5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spsb3Q571F5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spsb3Q571F5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spsb3Q571F5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spsb3Q571F5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spsb3Q571F5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spsb3Q571F5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spsb3Q571F5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spsb3Q571F5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spsb3Q571F5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spsb3Q571F5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spsb3Q571F5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spsb3Q571F5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spsb3Q571F5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spsb3Q571F5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spsb3Q571F5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Spsb3Q571F5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spsb3Q571F5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spsb3Q571F5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spsb3Q571F5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spsb3Q571F5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spsb3Q571F5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spsb3Q571F5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spsb3Q571F5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spsb3Q571F5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spsb3Q571F5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spsb3Q571F5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spsb3Q571F5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spsb3Q571F5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spsb3Q571F5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spsb3Q571F5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spsb3Q571F5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spsb3Q571F5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spsb3Q571F5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spsb3Q571F5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spsb3Q571F5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spsb3Q571F5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spsb3Q571F5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Spsb3Q571F5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spsb3Q571F5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spsb3Q571F5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spsb3Q571F5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spsb3Q571F5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spsb3Q571F5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spsb3Q571F5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spsb3Q571F5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spsb3Q571F5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spsb3Q571F5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spsb3Q571F5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spsb3Q571F5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spsb3Q571F5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spsb3Q571F5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spsb3Q571F5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spsb3Q571F5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spsb3Q571F5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spsb3Q571F5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Spsb3Q571F5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Spsb3Q571F5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spsb3Q571F5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spsb3Q571F5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spsb3Q571F5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spsb3Q571F5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Spsb3Q571F5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spsb3Q571F5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spsb3Q571F5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spsb3Q571F5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spsb3Q571F5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spsb3Q571F5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spsb3Q571F5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spsb3Q571F5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms