Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdp2Q504M2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdp2Q504M2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdp2Q504M2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdp2Q504M2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdp2Q504M2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdp2Q504M2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdp2Q504M2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdp2Q504M2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdp2Q504M2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdp2Q504M2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdp2Q504M2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdp2Q504M2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdp2Q504M2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdp2Q504M2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdp2Q504M2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdp2Q504M2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdp2Q504M2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdp2Q504M2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdp2Q504M2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdp2Q504M2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdp2Q504M2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdp2Q504M2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdp2Q504M2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdp2Q504M2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdp2Q504M2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdp2Q504M2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdp2Q504M2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdp2Q504M2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdp2Q504M2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdp2Q504M2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdp2Q504M2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdp2Q504M2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdp2Q504M2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdp2Q504M2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdp2Q504M2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdp2Q504M2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdp2Q504M2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdp2Q504M2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdp2Q504M2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdp2Q504M2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdp2Q504M2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdp2Q504M2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdp2Q504M2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdp2Q504M2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdp2Q504M2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdp2Q504M2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdp2Q504M2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdp2Q504M2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdp2Q504M2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdp2Q504M2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdp2Q504M2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdp2Q504M2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdp2Q504M2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdp2Q504M2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdp2Q504M2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdp2Q504M2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdp2Q504M2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdp2Q504M2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdp2Q504M2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdp2Q504M2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdp2Q504M2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdp2Q504M2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdp2Q504M2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdp2Q504M2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdp2Q504M2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdp2Q504M2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdp2Q504M2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms