Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc110Q3V125 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc110Q3V125 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc110Q3V125 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc110Q3V125 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc110Q3V125 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc110Q3V125 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc110Q3V125 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc110Q3V125 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc110Q3V125 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc110Q3V125 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc110Q3V125 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc110Q3V125 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc110Q3V125 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc110Q3V125 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc110Q3V125 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc110Q3V125 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc110Q3V125 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc110Q3V125 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc110Q3V125 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc110Q3V125 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc110Q3V125 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc110Q3V125 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc110Q3V125 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc110Q3V125 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc110Q3V125 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc110Q3V125 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc110Q3V125 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc110Q3V125 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc110Q3V125 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc110Q3V125 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc110Q3V125 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc110Q3V125 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc110Q3V125 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc110Q3V125 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc110Q3V125 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc110Q3V125 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc110Q3V125 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc110Q3V125 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc110Q3V125 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc110Q3V125 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc110Q3V125 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc110Q3V125 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc110Q3V125 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc110Q3V125 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc110Q3V125 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc110Q3V125 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc110Q3V125 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc110Q3V125 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc110Q3V125 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc110Q3V125 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc110Q3V125 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc110Q3V125 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc110Q3V125 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc110Q3V125 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc110Q3V125 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc110Q3V125 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc110Q3V125 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc110Q3V125 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc110Q3V125 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc110Q3V125 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc110Q3V125 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc110Q3V125 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc110Q3V125 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc110Q3V125 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc110Q3V125 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc110Q3V125 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc110Q3V125 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc110Q3V125 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc110Q3V125 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc110Q3V125 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc110Q3V125 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc110Q3V125 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc110Q3V125 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc110Q3V125 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc110Q3V125 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc110Q3V125 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc110Q3V125 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc110Q3V125 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc110Q3V125 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc110Q3V125 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc110Q3V125 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc110Q3V125 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc110Q3V125 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc110Q3V125 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc110Q3V125 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc110Q3V125 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc110Q3V125 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc110Q3V125 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc110Q3V125 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc110Q3V125 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc110Q3V125 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc110Q3V125 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc110Q3V125 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc110Q3V125 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc110Q3V125 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc110Q3V125 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc110Q3V125 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc110Q3V125 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc110Q3V125 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms