Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lrrc43Q3V0L5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lrrc43Q3V0L5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lrrc43Q3V0L5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lrrc43Q3V0L5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lrrc43Q3V0L5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lrrc43Q3V0L5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lrrc43Q3V0L5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lrrc43Q3V0L5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lrrc43Q3V0L5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lrrc43Q3V0L5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Lrrc43Q3V0L5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lrrc43Q3V0L5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lrrc43Q3V0L5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lrrc43Q3V0L5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lrrc43Q3V0L5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrrc43Q3V0L5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrrc43Q3V0L5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrrc43Q3V0L5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrrc43Q3V0L5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrrc43Q3V0L5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrrc43Q3V0L5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrrc43Q3V0L5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrrc43Q3V0L5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lrrc43Q3V0L5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lrrc43Q3V0L5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lrrc43Q3V0L5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Lrrc43Q3V0L5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lrrc43Q3V0L5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrrc43Q3V0L5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrrc43Q3V0L5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrrc43Q3V0L5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lrrc43Q3V0L5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lrrc43Q3V0L5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lrrc43Q3V0L5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lrrc43Q3V0L5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lrrc43Q3V0L5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lrrc43Q3V0L5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lrrc43Q3V0L5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lrrc43Q3V0L5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lrrc43Q3V0L5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lrrc43Q3V0L5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lrrc43Q3V0L5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Lrrc43Q3V0L5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lrrc43Q3V0L5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lrrc43Q3V0L5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrrc43Q3V0L5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrrc43Q3V0L5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrrc43Q3V0L5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrrc43Q3V0L5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrrc43Q3V0L5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrrc43Q3V0L5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lrrc43Q3V0L5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lrrc43Q3V0L5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrrc43Q3V0L5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrrc43Q3V0L5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrrc43Q3V0L5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrrc43Q3V0L5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lrrc43Q3V0L5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lrrc43Q3V0L5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lrrc43Q3V0L5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Lrrc43Q3V0L5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lrrc43Q3V0L5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lrrc43Q3V0L5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lrrc43Q3V0L5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lrrc43Q3V0L5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lrrc43Q3V0L5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Lrrc43Q3V0L5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lrrc43Q3V0L5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lrrc43Q3V0L5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Lrrc43Q3V0L5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lrrc43Q3V0L5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lrrc43Q3V0L5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Lrrc43Q3V0L5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Lrrc43Q3V0L5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lrrc43Q3V0L5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lrrc43Q3V0L5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lrrc43Q3V0L5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lrrc43Q3V0L5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lrrc43Q3V0L5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lrrc43Q3V0L5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lrrc43Q3V0L5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lrrc43Q3V0L5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lrrc43Q3V0L5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lrrc43Q3V0L5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lrrc43Q3V0L5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lrrc43Q3V0L5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lrrc43Q3V0L5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lrrc43Q3V0L5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lrrc43Q3V0L5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Lrrc43Q3V0L5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Lrrc43Q3V0L5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
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