Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbm44Q3V089 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbm44Q3V089 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbm44Q3V089 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbm44Q3V089 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbm44Q3V089 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbm44Q3V089 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbm44Q3V089 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbm44Q3V089 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbm44Q3V089 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbm44Q3V089 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbm44Q3V089 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbm44Q3V089 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbm44Q3V089 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbm44Q3V089 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbm44Q3V089 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbm44Q3V089 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbm44Q3V089 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbm44Q3V089 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbm44Q3V089 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbm44Q3V089 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbm44Q3V089 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbm44Q3V089 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rbm44Q3V089 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rbm44Q3V089 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbm44Q3V089 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbm44Q3V089 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbm44Q3V089 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbm44Q3V089 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbm44Q3V089 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbm44Q3V089 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbm44Q3V089 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbm44Q3V089 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbm44Q3V089 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbm44Q3V089 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbm44Q3V089 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbm44Q3V089 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbm44Q3V089 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbm44Q3V089 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbm44Q3V089 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbm44Q3V089 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbm44Q3V089 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbm44Q3V089 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbm44Q3V089 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbm44Q3V089 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbm44Q3V089 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbm44Q3V089 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbm44Q3V089 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbm44Q3V089 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbm44Q3V089 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbm44Q3V089 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbm44Q3V089 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbm44Q3V089 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rbm44Q3V089 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbm44Q3V089 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbm44Q3V089 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms