Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc27Q3V036 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc27Q3V036 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc27Q3V036 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc27Q3V036 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc27Q3V036 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc27Q3V036 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc27Q3V036 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc27Q3V036 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc27Q3V036 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccdc27Q3V036 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccdc27Q3V036 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc27Q3V036 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc27Q3V036 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc27Q3V036 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc27Q3V036 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc27Q3V036 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc27Q3V036 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc27Q3V036 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc27Q3V036 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc27Q3V036 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc27Q3V036 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc27Q3V036 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc27Q3V036 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc27Q3V036 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc27Q3V036 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc27Q3V036 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc27Q3V036 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc27Q3V036 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc27Q3V036 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc27Q3V036 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc27Q3V036 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc27Q3V036 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc27Q3V036 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc27Q3V036 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc27Q3V036 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc27Q3V036 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccdc27Q3V036 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccdc27Q3V036 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccdc27Q3V036 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc27Q3V036 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc27Q3V036 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc27Q3V036 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc27Q3V036 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc27Q3V036 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc27Q3V036 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc27Q3V036 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc27Q3V036 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc27Q3V036 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc27Q3V036 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc27Q3V036 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc27Q3V036 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc27Q3V036 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc27Q3V036 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc27Q3V036 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc27Q3V036 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc27Q3V036 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc27Q3V036 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc27Q3V036 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc27Q3V036 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc27Q3V036 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc27Q3V036 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc27Q3V036 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc27Q3V036 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc27Q3V036 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc27Q3V036 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc27Q3V036 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc27Q3V036 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc27Q3V036 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc27Q3V036 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc27Q3V036 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc27Q3V036 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc27Q3V036 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc27Q3V036 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc27Q3V036 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc27Q3V036 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc27Q3V036 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc27Q3V036 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc27Q3V036 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc27Q3V036 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc27Q3V036 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc27Q3V036 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc27Q3V036 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc27Q3V036 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ccdc27Q3V036 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc27Q3V036 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc27Q3V036 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc27Q3V036 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc27Q3V036 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc27Q3V036 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc27Q3V036 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc27Q3V036 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc27Q3V036 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc27Q3V036 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc27Q3V036 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc27Q3V036 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc27Q3V036 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc27Q3V036 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc27Q3V036 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc27Q3V036 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.7 ms